Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Me1P06801 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Me1P06801 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Me1P06801 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Me1P06801 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Me1P06801 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Me1P06801 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Me1P06801 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Me1P06801 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Me1P06801 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Me1P06801 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Me1P06801 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Me1P06801 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Me1P06801 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Me1P06801 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Me1P06801 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Me1P06801 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Me1P06801 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Me1P06801 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Me1P06801 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Me1P06801 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Me1P06801 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Me1P06801 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Me1P06801 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Me1P06801 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Me1P06801 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Me1P06801 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Me1P06801 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Me1P06801 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Me1P06801 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Me1P06801 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Me1P06801 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Me1P06801 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Me1P06801 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Me1P06801 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Me1P06801 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Me1P06801 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Me1P06801 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Me1P06801 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Me1P06801 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Me1P06801 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Me1P06801 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Me1P06801 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Me1P06801 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Me1P06801 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Me1P06801 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Me1P06801 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Me1P06801 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Me1P06801 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Me1P06801 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Me1P06801 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Me1P06801 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Me1P06801 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Me1P06801 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Me1P06801 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Me1P06801 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Me1P06801 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Me1P06801 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Me1P06801 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Me1P06801 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Me1P06801 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Me1P06801 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Me1P06801 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Me1P06801 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Me1P06801 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Me1P06801 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Me1P06801 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Me1P06801 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Me1P06801 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Me1P06801 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Me1P06801 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Me1P06801 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Me1P06801 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Me1P06801 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Me1P06801 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Me1P06801 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Me1P06801 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Me1P06801 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Me1P06801 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Me1P06801 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Me1P06801 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Me1P06801 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Me1P06801 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Me1P06801 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Me1P06801 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Me1P06801 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Me1P06801 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Me1P06801 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Me1P06801 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Me1P06801 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Me1P06801 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Me1P06801 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Me1P06801 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Me1P06801 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Me1P06801 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Me1P06801 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Me1P06801 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Me1P06801 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Me1P06801 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Me1P06801 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms