Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxa4P06798 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxa4P06798 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxa4P06798 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxa4P06798 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxa4P06798 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxa4P06798 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxa4P06798 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxa4P06798 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxa4P06798 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxa4P06798 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxa4P06798 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxa4P06798 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxa4P06798 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxa4P06798 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa4P06798 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa4P06798 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa4P06798 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa4P06798 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa4P06798 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxa4P06798 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa4P06798 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa4P06798 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa4P06798 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxa4P06798 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa4P06798 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa4P06798 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa4P06798 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa4P06798 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa4P06798 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa4P06798 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa4P06798 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa4P06798 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa4P06798 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxa4P06798 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxa4P06798 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa4P06798 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa4P06798 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa4P06798 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa4P06798 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa4P06798 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa4P06798 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxa4P06798 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxa4P06798 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxa4P06798 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa4P06798 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa4P06798 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa4P06798 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa4P06798 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa4P06798 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa4P06798 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa4P06798 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa4P06798 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa4P06798 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa4P06798 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa4P06798 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxa4P06798 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa4P06798 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa4P06798 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa4P06798 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa4P06798 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa4P06798 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa4P06798 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa4P06798 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa4P06798 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa4P06798 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa4P06798 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxa4P06798 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxa4P06798 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa4P06798 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa4P06798 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa4P06798 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxa4P06798 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxa4P06798 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxa4P06798 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxa4P06798 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa4P06798 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxa4P06798 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxa4P06798 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxa4P06798 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxa4P06798 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxa4P06798 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxa4P06798 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa4P06798 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa4P06798 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa4P06798 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa4P06798 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa4P06798 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa4P06798 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa4P06798 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa4P06798 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa4P06798 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxa4P06798 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxa4P06798 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxa4P06798 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa4P06798 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa4P06798 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxa4P06798 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxa4P06798 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxa4P06798 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms