Protein–RNA interactions for Protein: P05627

Jun, Transcription factor AP-1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JunP05627 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
JunP05627 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
JunP05627 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
JunP05627 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
JunP05627 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
JunP05627 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
JunP05627 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
JunP05627 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
JunP05627 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
JunP05627 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
JunP05627 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
JunP05627 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
JunP05627 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
JunP05627 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
JunP05627 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
JunP05627 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
JunP05627 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
JunP05627 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
JunP05627 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
JunP05627 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
JunP05627 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
JunP05627 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
JunP05627 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
JunP05627 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
JunP05627 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
JunP05627 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
JunP05627 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
JunP05627 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
JunP05627 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
JunP05627 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
JunP05627 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
JunP05627 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
JunP05627 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
JunP05627 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
JunP05627 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
JunP05627 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
JunP05627 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
JunP05627 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
JunP05627 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
JunP05627 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
JunP05627 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
JunP05627 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
JunP05627 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
JunP05627 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
JunP05627 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
JunP05627 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
JunP05627 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
JunP05627 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
JunP05627 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
JunP05627 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
JunP05627 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
JunP05627 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
JunP05627 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
JunP05627 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
JunP05627 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
JunP05627 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
JunP05627 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
JunP05627 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
JunP05627 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
JunP05627 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
JunP05627 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
JunP05627 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
JunP05627 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
JunP05627 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
JunP05627 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
JunP05627 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
JunP05627 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
JunP05627 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
JunP05627 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
JunP05627 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
JunP05627 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
JunP05627 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
JunP05627 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
JunP05627 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
JunP05627 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
JunP05627 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
JunP05627 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
JunP05627 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
JunP05627 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
JunP05627 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
JunP05627 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
JunP05627 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
JunP05627 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
JunP05627 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
JunP05627 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
JunP05627 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
JunP05627 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
JunP05627 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
JunP05627 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
JunP05627 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
JunP05627 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
JunP05627 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
JunP05627 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
JunP05627 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
JunP05627 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
JunP05627 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
JunP05627 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
JunP05627 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
JunP05627 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
JunP05627 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.8 ms