Protein–RNA interactions for Protein: P05201

Got1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Got1P05201 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Got1P05201 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Got1P05201 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Got1P05201 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Got1P05201 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Got1P05201 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Got1P05201 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Got1P05201 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Got1P05201 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Got1P05201 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Got1P05201 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Got1P05201 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Got1P05201 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Got1P05201 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Got1P05201 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Got1P05201 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Got1P05201 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Got1P05201 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Got1P05201 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Got1P05201 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Got1P05201 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Got1P05201 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Got1P05201 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Got1P05201 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Got1P05201 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Got1P05201 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Got1P05201 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Got1P05201 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Got1P05201 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Got1P05201 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Got1P05201 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Got1P05201 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Got1P05201 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Got1P05201 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Got1P05201 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Got1P05201 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Got1P05201 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Got1P05201 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Got1P05201 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Got1P05201 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Got1P05201 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Got1P05201 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Got1P05201 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Got1P05201 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Got1P05201 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Got1P05201 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Got1P05201 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Got1P05201 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Got1P05201 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Got1P05201 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Got1P05201 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Got1P05201 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Got1P05201 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Got1P05201 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Got1P05201 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Got1P05201 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Got1P05201 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Got1P05201 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Got1P05201 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Got1P05201 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Got1P05201 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Got1P05201 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Got1P05201 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Got1P05201 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Got1P05201 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Got1P05201 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Got1P05201 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Got1P05201 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Got1P05201 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Got1P05201 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Got1P05201 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Got1P05201 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Got1P05201 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Got1P05201 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Got1P05201 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Got1P05201 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Got1P05201 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Got1P05201 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Got1P05201 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Got1P05201 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Got1P05201 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Got1P05201 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Got1P05201 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Got1P05201 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Got1P05201 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Got1P05201 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Got1P05201 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Got1P05201 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Got1P05201 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Got1P05201 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Got1P05201 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Got1P05201 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Got1P05201 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Got1P05201 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Got1P05201 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Got1P05201 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Got1P05201 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Got1P05201 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Got1P05201 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Got1P05201 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.6 ms