Protein–RNA interactions for Protein: P05143

Prp2, Proline-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prp2P05143 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prp2P05143 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prp2P05143 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prp2P05143 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prp2P05143 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Prp2P05143 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prp2P05143 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prp2P05143 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prp2P05143 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prp2P05143 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prp2P05143 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prp2P05143 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prp2P05143 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prp2P05143 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prp2P05143 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prp2P05143 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prp2P05143 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prp2P05143 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prp2P05143 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prp2P05143 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prp2P05143 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prp2P05143 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prp2P05143 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prp2P05143 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prp2P05143 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prp2P05143 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prp2P05143 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prp2P05143 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prp2P05143 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prp2P05143 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prp2P05143 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prp2P05143 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prp2P05143 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prp2P05143 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prp2P05143 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prp2P05143 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prp2P05143 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prp2P05143 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prp2P05143 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prp2P05143 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prp2P05143 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prp2P05143 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prp2P05143 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prp2P05143 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prp2P05143 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prp2P05143 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prp2P05143 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prp2P05143 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prp2P05143 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prp2P05143 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prp2P05143 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prp2P05143 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prp2P05143 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prp2P05143 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prp2P05143 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prp2P05143 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prp2P05143 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prp2P05143 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prp2P05143 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prp2P05143 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prp2P05143 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prp2P05143 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prp2P05143 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prp2P05143 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prp2P05143 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prp2P05143 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prp2P05143 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prp2P05143 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prp2P05143 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prp2P05143 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prp2P05143 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prp2P05143 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prp2P05143 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prp2P05143 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prp2P05143 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prp2P05143 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prp2P05143 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prp2P05143 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prp2P05143 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prp2P05143 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prp2P05143 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prp2P05143 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prp2P05143 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prp2P05143 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prp2P05143 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prp2P05143 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prp2P05143 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prp2P05143 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prp2P05143 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prp2P05143 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prp2P05143 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prp2P05143 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prp2P05143 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prp2P05143 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prp2P05143 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prp2P05143 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prp2P05143 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prp2P05143 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prp2P05143 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prp2P05143 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms