Protein–RNA interactions for Protein: P05142

Prh1, Proline-rich protein HaeIII subfamily 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prh1P05142 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prh1P05142 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prh1P05142 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prh1P05142 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prh1P05142 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prh1P05142 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prh1P05142 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prh1P05142 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prh1P05142 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prh1P05142 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prh1P05142 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prh1P05142 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prh1P05142 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prh1P05142 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prh1P05142 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prh1P05142 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prh1P05142 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prh1P05142 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prh1P05142 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prh1P05142 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prh1P05142 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prh1P05142 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prh1P05142 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prh1P05142 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prh1P05142 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prh1P05142 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prh1P05142 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prh1P05142 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prh1P05142 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prh1P05142 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prh1P05142 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prh1P05142 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms