Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2-Eb1P04230 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
H2-Eb1P04230 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2-Eb1P04230 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2-Eb1P04230 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2-Eb1P04230 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2-Eb1P04230 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2-Eb1P04230 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2-Eb1P04230 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2-Eb1P04230 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2-Eb1P04230 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2-Eb1P04230 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2-Eb1P04230 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2-Eb1P04230 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2-Eb1P04230 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2-Eb1P04230 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2-Eb1P04230 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2-Eb1P04230 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2-Eb1P04230 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2-Eb1P04230 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2-Eb1P04230 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2-Eb1P04230 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2-Eb1P04230 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2-Eb1P04230 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
H2-Eb1P04230 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
H2-Eb1P04230 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2-Eb1P04230 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2-Eb1P04230 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2-Eb1P04230 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2-Eb1P04230 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2-Eb1P04230 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2-Eb1P04230 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2-Eb1P04230 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2-Eb1P04230 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-Eb1P04230 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-Eb1P04230 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-Eb1P04230 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-Eb1P04230 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2-Eb1P04230 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2-Eb1P04230 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
H2-Eb1P04230 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
H2-Eb1P04230 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2-Eb1P04230 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2-Eb1P04230 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-Eb1P04230 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-Eb1P04230 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2-Eb1P04230 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2-Eb1P04230 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2-Eb1P04230 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2-Eb1P04230 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2-Eb1P04230 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2-Eb1P04230 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-Eb1P04230 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-Eb1P04230 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-Eb1P04230 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-Eb1P04230 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-Eb1P04230 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-Eb1P04230 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-Eb1P04230 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-Eb1P04230 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-Eb1P04230 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-Eb1P04230 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-Eb1P04230 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-Eb1P04230 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-Eb1P04230 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-Eb1P04230 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2-Eb1P04230 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2-Eb1P04230 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-Eb1P04230 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-Eb1P04230 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-Eb1P04230 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-Eb1P04230 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-Eb1P04230 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-Eb1P04230 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-Eb1P04230 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-Eb1P04230 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-Eb1P04230 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-Eb1P04230 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-Eb1P04230 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-Eb1P04230 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-Eb1P04230 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-Eb1P04230 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-Eb1P04230 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-Eb1P04230 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-Eb1P04230 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-Eb1P04230 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-Eb1P04230 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-Eb1P04230 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-Eb1P04230 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-Eb1P04230 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-Eb1P04230 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-Eb1P04230 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-Eb1P04230 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-Eb1P04230 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-Eb1P04230 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-Eb1P04230 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-Eb1P04230 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-Eb1P04230 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-Eb1P04230 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-Eb1P04230 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms