Protein–RNA interactions for Protein: P01897

H2-L, H-2 class I histocompatibility antigen, L-D alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-LP01897 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-LP01897 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-LP01897 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-LP01897 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-LP01897 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-LP01897 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-LP01897 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-LP01897 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-LP01897 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-LP01897 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-LP01897 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-LP01897 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-LP01897 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-LP01897 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-LP01897 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-LP01897 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-LP01897 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-LP01897 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-LP01897 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-LP01897 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-LP01897 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-LP01897 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-LP01897 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-LP01897 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-LP01897 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-LP01897 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-LP01897 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-LP01897 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-LP01897 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-LP01897 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-LP01897 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-LP01897 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-LP01897 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-LP01897 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-LP01897 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-LP01897 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-LP01897 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2-LP01897 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-LP01897 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-LP01897 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-LP01897 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-LP01897 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-LP01897 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-LP01897 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-LP01897 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-LP01897 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-LP01897 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-LP01897 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-LP01897 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-LP01897 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-LP01897 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-LP01897 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-LP01897 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-LP01897 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-LP01897 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-LP01897 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-LP01897 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-LP01897 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-LP01897 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-LP01897 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-LP01897 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-LP01897 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-LP01897 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-LP01897 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-LP01897 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-LP01897 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-LP01897 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-LP01897 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H2-LP01897 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.31■■□□□ 1
H2-LP01897 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-LP01897 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-LP01897 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.31■■□□□ 1
H2-LP01897 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-LP01897 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-LP01897 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.3■■□□□ 1
H2-LP01897 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-LP01897 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-LP01897 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-LP01897 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-LP01897 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-LP01897 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-LP01897 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H2-LP01897 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-LP01897 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-LP01897 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-LP01897 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
H2-LP01897 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-LP01897 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-LP01897 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-LP01897 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-LP01897 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-LP01897 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-LP01897 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-LP01897 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-LP01897 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-LP01897 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-LP01897 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-LP01897 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-LP01897 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-LP01897 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms