Protein–RNA interactions for Protein: P01756

Ig heavy chain V region MOPC 104E, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01756 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01756 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01756 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01756 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01756 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01756 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01756 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01756 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01756 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01756 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01756 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01756 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01756 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01756 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01756 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01756 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01756 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01756 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01756 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01756 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01756 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01756 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01756 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01756 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01756 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01756 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01756 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01756 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01756 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01756 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01756 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01756 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01756 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01756 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01756 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P01756 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01756 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01756 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01756 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01756 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01756 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01756 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
P01756 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01756 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01756 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01756 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01756 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01756 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01756 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01756 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01756 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01756 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01756 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01756 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01756 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01756 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01756 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01756 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01756 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01756 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01756 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01756 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01756 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01756 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01756 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01756 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01756 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01756 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01756 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01756 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01756 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01756 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01756 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01756 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01756 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01756 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01756 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01756 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01756 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01756 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01756 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01756 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01756 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01756 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01756 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01756 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01756 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01756 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01756 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01756 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01756 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01756 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
P01756 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01756 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01756 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01756 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01756 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01756 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01756 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01756 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms