Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
P01735 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,72■■□□□ 1,07
P01735 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
P01735 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
P01735 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
P01735 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
P01735 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
P01735 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
P01735 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
P01735 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
P01735 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
P01735 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
P01735 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
P01735 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
P01735 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
P01735 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
P01735 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
P01735 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
P01735 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
P01735 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
P01735 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
P01735 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
P01735 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
P01735 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
P01735 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
P01735 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
P01735 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
P01735 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
P01735 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,06
P01735 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,06
P01735 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
P01735 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
P01735 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
P01735 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21,63■■□□□ 1,05
P01735 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,63■■□□□ 1,05
P01735 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21,63■■□□□ 1,05
P01735 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
P01735 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
P01735 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
P01735 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21,61■■□□□ 1,05
P01735 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21,61■■□□□ 1,05
P01735 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
P01735 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,6■■□□□ 1,05
P01735 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
P01735 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
P01735 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
P01735 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
P01735 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
P01735 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
P01735 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
P01735 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,05
P01735 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,05
P01735 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,05
P01735 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
P01735 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21,56■■□□□ 1,04
P01735 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21,56■■□□□ 1,04
P01735 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21,55■■□□□ 1,04
P01735 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
P01735 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21,53■■□□□ 1,04
P01735 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
P01735 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
P01735 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
P01735 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
P01735 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
P01735 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21,52■■□□□ 1,04
P01735 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
P01735 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,03
P01735 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,03
P01735 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21,52■■□□□ 1,03
P01735 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21,51■■□□□ 1,03
P01735 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21,51■■□□□ 1,03
P01735 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
P01735 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
P01735 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
P01735 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
P01735 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21,48■■□□□ 1,03
P01735 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
P01735 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
P01735 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
P01735 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
P01735 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21,47■■□□□ 1,03
P01735 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
P01735 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
P01735 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21,46■■□□□ 1,03
P01735 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21,46■■□□□ 1,03
P01735 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21,46■■□□□ 1,03
P01735 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21,46■■□□□ 1,03
P01735 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
P01735 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21,45■■□□□ 1,02
P01735 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
P01735 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
P01735 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
P01735 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,44■■□□□ 1,02
P01735 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
P01735 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,44■■□□□ 1,02
P01735 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,43■■□□□ 1,02
P01735 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21,43■■□□□ 1,02
P01735 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,43■■□□□ 1,02
P01735 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
P01735 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,7 ms