Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
F11rO88792 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F11rO88792 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F11rO88792 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F11rO88792 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F11rO88792 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F11rO88792 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F11rO88792 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F11rO88792 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
F11rO88792 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F11rO88792 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F11rO88792 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
F11rO88792 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
F11rO88792 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
F11rO88792 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
F11rO88792 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
F11rO88792 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
F11rO88792 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
F11rO88792 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F11rO88792 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F11rO88792 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
F11rO88792 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F11rO88792 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
F11rO88792 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
F11rO88792 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
F11rO88792 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
F11rO88792 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
F11rO88792 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
F11rO88792 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
F11rO88792 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
F11rO88792 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
F11rO88792 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
F11rO88792 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
F11rO88792 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
F11rO88792 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
F11rO88792 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
F11rO88792 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
F11rO88792 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
F11rO88792 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
F11rO88792 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
F11rO88792 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
F11rO88792 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
F11rO88792 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
F11rO88792 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
F11rO88792 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
F11rO88792 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
F11rO88792 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
F11rO88792 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
F11rO88792 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
F11rO88792 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
F11rO88792 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
F11rO88792 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
F11rO88792 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
F11rO88792 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
F11rO88792 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
F11rO88792 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
F11rO88792 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
F11rO88792 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
F11rO88792 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
F11rO88792 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
F11rO88792 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
F11rO88792 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
F11rO88792 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
F11rO88792 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
F11rO88792 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
F11rO88792 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
F11rO88792 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
F11rO88792 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
F11rO88792 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
F11rO88792 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
F11rO88792 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
F11rO88792 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
F11rO88792 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
F11rO88792 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
F11rO88792 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
F11rO88792 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
F11rO88792 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
F11rO88792 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
F11rO88792 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
F11rO88792 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
F11rO88792 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
F11rO88792 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
F11rO88792 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
F11rO88792 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
F11rO88792 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
F11rO88792 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
F11rO88792 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
F11rO88792 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
F11rO88792 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
F11rO88792 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
F11rO88792 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
F11rO88792 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
F11rO88792 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
F11rO88792 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
F11rO88792 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
F11rO88792 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
F11rO88792 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
F11rO88792 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
F11rO88792 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
F11rO88792 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms