Protein–RNA interactions for Protein: O88667

Rrad, GTP-binding protein RAD, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RradO88667 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RradO88667 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RradO88667 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RradO88667 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RradO88667 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RradO88667 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RradO88667 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RradO88667 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RradO88667 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RradO88667 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RradO88667 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RradO88667 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RradO88667 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RradO88667 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RradO88667 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RradO88667 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RradO88667 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RradO88667 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RradO88667 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RradO88667 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RradO88667 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RradO88667 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RradO88667 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RradO88667 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RradO88667 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RradO88667 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RradO88667 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RradO88667 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RradO88667 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RradO88667 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RradO88667 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RradO88667 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RradO88667 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RradO88667 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RradO88667 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RradO88667 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RradO88667 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RradO88667 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RradO88667 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RradO88667 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RradO88667 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RradO88667 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RradO88667 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RradO88667 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RradO88667 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RradO88667 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RradO88667 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RradO88667 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RradO88667 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RradO88667 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RradO88667 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RradO88667 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RradO88667 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RradO88667 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RradO88667 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RradO88667 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RradO88667 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RradO88667 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RradO88667 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RradO88667 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RradO88667 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RradO88667 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RradO88667 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RradO88667 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RradO88667 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RradO88667 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RradO88667 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RradO88667 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RradO88667 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RradO88667 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RradO88667 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RradO88667 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RradO88667 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RradO88667 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RradO88667 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RradO88667 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RradO88667 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RradO88667 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RradO88667 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RradO88667 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RradO88667 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RradO88667 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RradO88667 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RradO88667 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RradO88667 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RradO88667 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RradO88667 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RradO88667 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RradO88667 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RradO88667 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RradO88667 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RradO88667 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RradO88667 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RradO88667 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RradO88667 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RradO88667 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RradO88667 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RradO88667 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RradO88667 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RradO88667 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms