Protein–RNA interactions for Protein: O88343

Slc4a4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a4O88343 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slc4a4O88343 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slc4a4O88343 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slc4a4O88343 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Slc4a4O88343 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slc4a4O88343 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slc4a4O88343 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slc4a4O88343 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slc4a4O88343 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slc4a4O88343 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slc4a4O88343 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slc4a4O88343 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slc4a4O88343 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slc4a4O88343 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slc4a4O88343 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slc4a4O88343 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slc4a4O88343 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slc4a4O88343 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Slc4a4O88343 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slc4a4O88343 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slc4a4O88343 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slc4a4O88343 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slc4a4O88343 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slc4a4O88343 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slc4a4O88343 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slc4a4O88343 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slc4a4O88343 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Slc4a4O88343 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slc4a4O88343 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slc4a4O88343 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Slc4a4O88343 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slc4a4O88343 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slc4a4O88343 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slc4a4O88343 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slc4a4O88343 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Slc4a4O88343 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slc4a4O88343 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slc4a4O88343 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slc4a4O88343 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slc4a4O88343 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Slc4a4O88343 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slc4a4O88343 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slc4a4O88343 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slc4a4O88343 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Slc4a4O88343 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slc4a4O88343 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slc4a4O88343 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slc4a4O88343 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slc4a4O88343 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slc4a4O88343 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slc4a4O88343 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slc4a4O88343 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slc4a4O88343 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slc4a4O88343 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slc4a4O88343 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slc4a4O88343 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slc4a4O88343 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slc4a4O88343 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slc4a4O88343 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slc4a4O88343 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slc4a4O88343 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slc4a4O88343 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slc4a4O88343 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slc4a4O88343 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slc4a4O88343 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slc4a4O88343 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slc4a4O88343 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Slc4a4O88343 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Slc4a4O88343 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Slc4a4O88343 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slc4a4O88343 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slc4a4O88343 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slc4a4O88343 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slc4a4O88343 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slc4a4O88343 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slc4a4O88343 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slc4a4O88343 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc4a4O88343 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Slc4a4O88343 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Slc4a4O88343 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slc4a4O88343 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slc4a4O88343 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slc4a4O88343 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slc4a4O88343 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slc4a4O88343 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Slc4a4O88343 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Slc4a4O88343 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slc4a4O88343 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc4a4O88343 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slc4a4O88343 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slc4a4O88343 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slc4a4O88343 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slc4a4O88343 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slc4a4O88343 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slc4a4O88343 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slc4a4O88343 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slc4a4O88343 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slc4a4O88343 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Slc4a4O88343 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slc4a4O88343 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms