Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Nid2O88322 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Nid2O88322 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Nid2O88322 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC31,91■■■□□ 2,7
Nid2O88322 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC31,9■■■□□ 2,7
Nid2O88322 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC31,9■■■□□ 2,7
Nid2O88322 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC31,9■■■□□ 2,7
Nid2O88322 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Nid2O88322 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Nid2O88322 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,87■■■□□ 2,69
Nid2O88322 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Nid2O88322 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Nid2O88322 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Nid2O88322 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Nid2O88322 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC31,83■■■□□ 2,69
Nid2O88322 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
Nid2O88322 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC31,83■■■□□ 2,69
Nid2O88322 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC31,82■■■□□ 2,69
Nid2O88322 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC31,82■■■□□ 2,68
Nid2O88322 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Nid2O88322 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Nid2O88322 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC31,81■■■□□ 2,68
Nid2O88322 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Nid2O88322 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC31,77■■■□□ 2,68
Nid2O88322 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,77■■■□□ 2,68
Nid2O88322 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,68
Nid2O88322 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC31,76■■■□□ 2,68
Nid2O88322 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,68
Nid2O88322 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Nid2O88322 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Nid2O88322 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Nid2O88322 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Nid2O88322 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Nid2O88322 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Nid2O88322 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Nid2O88322 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC31,73■■■□□ 2,67
Nid2O88322 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Nid2O88322 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC31,71■■■□□ 2,67
Nid2O88322 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC31,71■■■□□ 2,67
Nid2O88322 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Nid2O88322 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,7■■■□□ 2,67
Nid2O88322 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC31,7■■■□□ 2,67
Nid2O88322 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,67
Nid2O88322 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,67
Nid2O88322 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Nid2O88322 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Nid2O88322 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Nid2O88322 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Nid2O88322 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Nid2O88322 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Nid2O88322 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC31,66■■■□□ 2,66
Nid2O88322 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Nid2O88322 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Nid2O88322 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Nid2O88322 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,65
Nid2O88322 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Nid2O88322 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Nid2O88322 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Nid2O88322 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Nid2O88322 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Nid2O88322 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC31,62■■■□□ 2,65
Nid2O88322 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Nid2O88322 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC31,61■■■□□ 2,65
Nid2O88322 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC31,6■■■□□ 2,65
Nid2O88322 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Nid2O88322 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Nid2O88322 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC31,59■■■□□ 2,65
Nid2O88322 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Nid2O88322 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC31,57■■■□□ 2,64
Nid2O88322 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC31,57■■■□□ 2,64
Nid2O88322 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Nid2O88322 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Nid2O88322 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC31,56■■■□□ 2,64
Nid2O88322 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Nid2O88322 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Nid2O88322 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Nid2O88322 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC31,54■■■□□ 2,64
Nid2O88322 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Nid2O88322 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,52■■■□□ 2,64
Nid2O88322 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC31,51■■■□□ 2,64
Nid2O88322 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,64
Nid2O88322 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Nid2O88322 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Nid2O88322 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC31,5■■■□□ 2,63
Nid2O88322 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Nid2O88322 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Nid2O88322 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Nid2O88322 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC31,49■■■□□ 2,63
Nid2O88322 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC31,49■■■□□ 2,63
Nid2O88322 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Nid2O88322 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Nid2O88322 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Nid2O88322 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC31,48■■■□□ 2,63
Nid2O88322 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Nid2O88322 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Nid2O88322 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Nid2O88322 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC31,45■■■□□ 2,63
Nid2O88322 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Nid2O88322 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,45■■■□□ 2,62
Nid2O88322 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30,2 ms