Protein–RNA interactions for Protein: O70493

Snx12, Sorting nexin-12, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx12O70493 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Snx12O70493 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snx12O70493 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snx12O70493 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snx12O70493 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snx12O70493 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Snx12O70493 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snx12O70493 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snx12O70493 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx12O70493 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx12O70493 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx12O70493 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx12O70493 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx12O70493 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx12O70493 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx12O70493 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx12O70493 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx12O70493 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx12O70493 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx12O70493 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx12O70493 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx12O70493 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx12O70493 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx12O70493 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx12O70493 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx12O70493 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx12O70493 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx12O70493 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx12O70493 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx12O70493 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx12O70493 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx12O70493 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx12O70493 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx12O70493 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx12O70493 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx12O70493 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snx12O70493 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snx12O70493 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snx12O70493 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx12O70493 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx12O70493 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx12O70493 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx12O70493 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx12O70493 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx12O70493 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx12O70493 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx12O70493 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx12O70493 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx12O70493 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx12O70493 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snx12O70493 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snx12O70493 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx12O70493 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx12O70493 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx12O70493 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx12O70493 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx12O70493 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx12O70493 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx12O70493 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx12O70493 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx12O70493 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx12O70493 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx12O70493 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx12O70493 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx12O70493 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx12O70493 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx12O70493 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx12O70493 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx12O70493 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx12O70493 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx12O70493 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx12O70493 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx12O70493 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx12O70493 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx12O70493 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx12O70493 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx12O70493 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx12O70493 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx12O70493 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx12O70493 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx12O70493 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx12O70493 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx12O70493 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx12O70493 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx12O70493 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx12O70493 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx12O70493 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx12O70493 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx12O70493 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx12O70493 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx12O70493 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx12O70493 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx12O70493 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx12O70493 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx12O70493 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx12O70493 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx12O70493 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx12O70493 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx12O70493 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx12O70493 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms