Protein–RNA interactions for Protein: O70138

Mmp8, Neutrophil collagenase, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp8O70138 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Mmp8O70138 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mmp8O70138 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mmp8O70138 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mmp8O70138 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mmp8O70138 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Mmp8O70138 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Mmp8O70138 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mmp8O70138 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mmp8O70138 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mmp8O70138 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Mmp8O70138 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Mmp8O70138 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Mmp8O70138 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Mmp8O70138 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Mmp8O70138 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Mmp8O70138 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Mmp8O70138 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Mmp8O70138 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mmp8O70138 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mmp8O70138 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mmp8O70138 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mmp8O70138 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mmp8O70138 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mmp8O70138 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mmp8O70138 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mmp8O70138 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mmp8O70138 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Mmp8O70138 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Mmp8O70138 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Mmp8O70138 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Mmp8O70138 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Mmp8O70138 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Mmp8O70138 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Mmp8O70138 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Mmp8O70138 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Mmp8O70138 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Mmp8O70138 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Mmp8O70138 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Mmp8O70138 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Mmp8O70138 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Mmp8O70138 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Mmp8O70138 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Mmp8O70138 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Mmp8O70138 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Mmp8O70138 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mmp8O70138 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mmp8O70138 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mmp8O70138 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mmp8O70138 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Mmp8O70138 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Mmp8O70138 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Mmp8O70138 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mmp8O70138 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mmp8O70138 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Mmp8O70138 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Mmp8O70138 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Mmp8O70138 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Mmp8O70138 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mmp8O70138 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mmp8O70138 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Mmp8O70138 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Mmp8O70138 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Mmp8O70138 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Mmp8O70138 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Mmp8O70138 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Mmp8O70138 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Mmp8O70138 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mmp8O70138 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mmp8O70138 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mmp8O70138 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mmp8O70138 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mmp8O70138 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mmp8O70138 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mmp8O70138 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Mmp8O70138 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Mmp8O70138 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Mmp8O70138 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Mmp8O70138 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Mmp8O70138 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Mmp8O70138 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mmp8O70138 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mmp8O70138 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Mmp8O70138 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Mmp8O70138 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mmp8O70138 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Mmp8O70138 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Mmp8O70138 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Mmp8O70138 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mmp8O70138 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Mmp8O70138 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Mmp8O70138 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Mmp8O70138 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Mmp8O70138 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mmp8O70138 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mmp8O70138 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Mmp8O70138 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mmp8O70138 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mmp8O70138 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mmp8O70138 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms