Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ChkbO55229 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ChkbO55229 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ChkbO55229 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ChkbO55229 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ChkbO55229 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ChkbO55229 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ChkbO55229 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ChkbO55229 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ChkbO55229 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ChkbO55229 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ChkbO55229 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ChkbO55229 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ChkbO55229 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ChkbO55229 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ChkbO55229 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ChkbO55229 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ChkbO55229 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ChkbO55229 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ChkbO55229 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChkbO55229 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChkbO55229 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChkbO55229 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ChkbO55229 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ChkbO55229 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ChkbO55229 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ChkbO55229 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ChkbO55229 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ChkbO55229 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ChkbO55229 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ChkbO55229 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ChkbO55229 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ChkbO55229 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ChkbO55229 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ChkbO55229 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ChkbO55229 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ChkbO55229 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ChkbO55229 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ChkbO55229 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ChkbO55229 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ChkbO55229 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ChkbO55229 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ChkbO55229 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ChkbO55229 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ChkbO55229 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ChkbO55229 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ChkbO55229 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ChkbO55229 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ChkbO55229 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ChkbO55229 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ChkbO55229 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ChkbO55229 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ChkbO55229 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ChkbO55229 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ChkbO55229 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ChkbO55229 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ChkbO55229 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ChkbO55229 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ChkbO55229 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ChkbO55229 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ChkbO55229 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ChkbO55229 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ChkbO55229 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ChkbO55229 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ChkbO55229 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ChkbO55229 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ChkbO55229 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ChkbO55229 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ChkbO55229 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ChkbO55229 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ChkbO55229 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ChkbO55229 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ChkbO55229 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ChkbO55229 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ChkbO55229 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ChkbO55229 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ChkbO55229 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ChkbO55229 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ChkbO55229 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ChkbO55229 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ChkbO55229 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ChkbO55229 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ChkbO55229 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ChkbO55229 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ChkbO55229 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ChkbO55229 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ChkbO55229 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ChkbO55229 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ChkbO55229 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ChkbO55229 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ChkbO55229 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ChkbO55229 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ChkbO55229 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ChkbO55229 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ChkbO55229 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ChkbO55229 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ChkbO55229 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ChkbO55229 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ChkbO55229 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ChkbO55229 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms