Protein–RNA interactions for Protein: O55112

Aff2, AF4/FMR2 family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff2O55112 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aff2O55112 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aff2O55112 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aff2O55112 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aff2O55112 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Aff2O55112 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aff2O55112 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aff2O55112 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aff2O55112 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aff2O55112 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aff2O55112 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aff2O55112 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aff2O55112 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Aff2O55112 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aff2O55112 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aff2O55112 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aff2O55112 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aff2O55112 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aff2O55112 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aff2O55112 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aff2O55112 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aff2O55112 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Aff2O55112 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aff2O55112 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aff2O55112 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aff2O55112 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aff2O55112 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aff2O55112 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aff2O55112 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Aff2O55112 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Aff2O55112 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Aff2O55112 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Aff2O55112 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aff2O55112 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aff2O55112 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aff2O55112 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aff2O55112 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Aff2O55112 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aff2O55112 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aff2O55112 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Aff2O55112 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Aff2O55112 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Aff2O55112 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aff2O55112 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aff2O55112 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aff2O55112 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aff2O55112 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aff2O55112 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aff2O55112 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aff2O55112 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aff2O55112 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aff2O55112 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aff2O55112 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aff2O55112 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aff2O55112 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aff2O55112 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aff2O55112 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aff2O55112 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aff2O55112 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aff2O55112 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aff2O55112 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aff2O55112 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aff2O55112 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aff2O55112 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aff2O55112 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aff2O55112 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aff2O55112 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aff2O55112 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aff2O55112 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aff2O55112 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aff2O55112 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aff2O55112 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aff2O55112 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aff2O55112 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aff2O55112 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aff2O55112 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aff2O55112 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aff2O55112 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aff2O55112 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aff2O55112 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aff2O55112 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aff2O55112 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aff2O55112 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aff2O55112 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aff2O55112 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aff2O55112 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aff2O55112 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aff2O55112 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aff2O55112 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aff2O55112 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aff2O55112 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aff2O55112 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Aff2O55112 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Aff2O55112 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aff2O55112 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aff2O55112 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aff2O55112 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aff2O55112 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aff2O55112 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aff2O55112 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.7 ms