Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trappc3O55013 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trappc3O55013 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trappc3O55013 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Trappc3O55013 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trappc3O55013 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trappc3O55013 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trappc3O55013 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trappc3O55013 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc3O55013 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc3O55013 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc3O55013 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc3O55013 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc3O55013 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc3O55013 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc3O55013 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trappc3O55013 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trappc3O55013 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trappc3O55013 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trappc3O55013 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc3O55013 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc3O55013 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trappc3O55013 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trappc3O55013 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trappc3O55013 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trappc3O55013 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trappc3O55013 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc3O55013 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc3O55013 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc3O55013 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc3O55013 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc3O55013 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc3O55013 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trappc3O55013 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trappc3O55013 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trappc3O55013 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trappc3O55013 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trappc3O55013 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trappc3O55013 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trappc3O55013 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trappc3O55013 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trappc3O55013 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trappc3O55013 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trappc3O55013 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trappc3O55013 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trappc3O55013 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc3O55013 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc3O55013 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc3O55013 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc3O55013 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Trappc3O55013 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trappc3O55013 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trappc3O55013 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trappc3O55013 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc3O55013 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trappc3O55013 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trappc3O55013 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc3O55013 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trappc3O55013 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Trappc3O55013 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trappc3O55013 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc3O55013 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc3O55013 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc3O55013 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trappc3O55013 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trappc3O55013 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trappc3O55013 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trappc3O55013 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc3O55013 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trappc3O55013 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trappc3O55013 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trappc3O55013 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trappc3O55013 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc3O55013 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc3O55013 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc3O55013 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc3O55013 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc3O55013 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc3O55013 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc3O55013 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc3O55013 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trappc3O55013 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trappc3O55013 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trappc3O55013 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trappc3O55013 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trappc3O55013 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trappc3O55013 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trappc3O55013 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc3O55013 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc3O55013 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc3O55013 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc3O55013 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc3O55013 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc3O55013 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trappc3O55013 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trappc3O55013 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trappc3O55013 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trappc3O55013 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trappc3O55013 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trappc3O55013 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms