Protein–RNA interactions for Protein: O54839

Eomes, Eomesodermin homolog, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EomesO54839 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EomesO54839 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EomesO54839 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EomesO54839 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EomesO54839 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EomesO54839 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EomesO54839 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EomesO54839 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EomesO54839 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EomesO54839 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EomesO54839 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EomesO54839 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EomesO54839 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EomesO54839 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EomesO54839 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EomesO54839 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EomesO54839 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EomesO54839 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EomesO54839 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EomesO54839 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EomesO54839 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EomesO54839 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EomesO54839 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EomesO54839 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EomesO54839 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EomesO54839 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EomesO54839 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EomesO54839 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EomesO54839 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EomesO54839 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EomesO54839 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EomesO54839 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EomesO54839 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EomesO54839 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EomesO54839 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EomesO54839 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EomesO54839 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EomesO54839 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EomesO54839 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EomesO54839 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EomesO54839 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EomesO54839 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EomesO54839 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EomesO54839 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EomesO54839 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EomesO54839 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EomesO54839 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EomesO54839 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EomesO54839 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EomesO54839 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EomesO54839 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EomesO54839 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EomesO54839 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EomesO54839 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EomesO54839 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EomesO54839 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EomesO54839 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EomesO54839 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EomesO54839 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EomesO54839 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EomesO54839 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EomesO54839 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EomesO54839 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EomesO54839 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EomesO54839 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EomesO54839 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EomesO54839 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EomesO54839 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EomesO54839 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EomesO54839 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EomesO54839 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EomesO54839 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EomesO54839 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EomesO54839 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EomesO54839 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EomesO54839 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EomesO54839 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EomesO54839 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EomesO54839 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EomesO54839 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EomesO54839 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EomesO54839 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EomesO54839 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EomesO54839 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EomesO54839 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EomesO54839 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EomesO54839 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EomesO54839 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EomesO54839 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EomesO54839 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EomesO54839 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EomesO54839 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EomesO54839 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EomesO54839 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EomesO54839 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EomesO54839 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EomesO54839 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EomesO54839 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EomesO54839 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EomesO54839 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms