Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tpd52l1O54818 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tpd52l1O54818 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tpd52l1O54818 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Tpd52l1O54818 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Tpd52l1O54818 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tpd52l1O54818 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tpd52l1O54818 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tpd52l1O54818 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tpd52l1O54818 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Tpd52l1O54818 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tpd52l1O54818 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tpd52l1O54818 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tpd52l1O54818 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tpd52l1O54818 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tpd52l1O54818 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tpd52l1O54818 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tpd52l1O54818 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tpd52l1O54818 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tpd52l1O54818 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tpd52l1O54818 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tpd52l1O54818 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tpd52l1O54818 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tpd52l1O54818 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tpd52l1O54818 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tpd52l1O54818 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tpd52l1O54818 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tpd52l1O54818 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tpd52l1O54818 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tpd52l1O54818 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tpd52l1O54818 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tpd52l1O54818 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tpd52l1O54818 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tpd52l1O54818 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tpd52l1O54818 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tpd52l1O54818 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tpd52l1O54818 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tpd52l1O54818 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tpd52l1O54818 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tpd52l1O54818 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tpd52l1O54818 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tpd52l1O54818 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tpd52l1O54818 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tpd52l1O54818 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tpd52l1O54818 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tpd52l1O54818 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tpd52l1O54818 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tpd52l1O54818 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tpd52l1O54818 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tpd52l1O54818 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tpd52l1O54818 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tpd52l1O54818 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tpd52l1O54818 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tpd52l1O54818 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tpd52l1O54818 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tpd52l1O54818 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tpd52l1O54818 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tpd52l1O54818 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tpd52l1O54818 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tpd52l1O54818 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tpd52l1O54818 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tpd52l1O54818 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tpd52l1O54818 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tpd52l1O54818 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tpd52l1O54818 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Tpd52l1O54818 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tpd52l1O54818 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tpd52l1O54818 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tpd52l1O54818 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Tpd52l1O54818 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tpd52l1O54818 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tpd52l1O54818 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tpd52l1O54818 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tpd52l1O54818 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tpd52l1O54818 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Tpd52l1O54818 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tpd52l1O54818 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tpd52l1O54818 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tpd52l1O54818 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tpd52l1O54818 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tpd52l1O54818 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tpd52l1O54818 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tpd52l1O54818 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tpd52l1O54818 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tpd52l1O54818 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tpd52l1O54818 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tpd52l1O54818 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tpd52l1O54818 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tpd52l1O54818 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tpd52l1O54818 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tpd52l1O54818 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tpd52l1O54818 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tpd52l1O54818 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tpd52l1O54818 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tpd52l1O54818 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tpd52l1O54818 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tpd52l1O54818 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tpd52l1O54818 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tpd52l1O54818 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tpd52l1O54818 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms