Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Limk2O54785 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Limk2O54785 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Limk2O54785 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Limk2O54785 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Limk2O54785 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Limk2O54785 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Limk2O54785 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Limk2O54785 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Limk2O54785 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Limk2O54785 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Limk2O54785 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Limk2O54785 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Limk2O54785 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Limk2O54785 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Limk2O54785 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Limk2O54785 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Limk2O54785 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Limk2O54785 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Limk2O54785 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Limk2O54785 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Limk2O54785 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Limk2O54785 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Limk2O54785 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Limk2O54785 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Limk2O54785 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Limk2O54785 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Limk2O54785 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Limk2O54785 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Limk2O54785 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Limk2O54785 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Limk2O54785 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Limk2O54785 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Limk2O54785 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Limk2O54785 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Limk2O54785 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Limk2O54785 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Limk2O54785 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Limk2O54785 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Limk2O54785 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Limk2O54785 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Limk2O54785 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Limk2O54785 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Limk2O54785 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Limk2O54785 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Limk2O54785 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Limk2O54785 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Limk2O54785 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Limk2O54785 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Limk2O54785 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Limk2O54785 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Limk2O54785 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Limk2O54785 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Limk2O54785 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Limk2O54785 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Limk2O54785 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Limk2O54785 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Limk2O54785 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Limk2O54785 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Limk2O54785 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Limk2O54785 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Limk2O54785 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Limk2O54785 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Limk2O54785 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Limk2O54785 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Limk2O54785 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Limk2O54785 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Limk2O54785 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Limk2O54785 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Limk2O54785 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Limk2O54785 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Limk2O54785 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Limk2O54785 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Limk2O54785 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Limk2O54785 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Limk2O54785 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Limk2O54785 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Limk2O54785 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Limk2O54785 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Limk2O54785 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Limk2O54785 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Limk2O54785 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Limk2O54785 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Limk2O54785 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Limk2O54785 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Limk2O54785 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Limk2O54785 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Limk2O54785 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Limk2O54785 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Limk2O54785 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Limk2O54785 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Limk2O54785 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Limk2O54785 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Limk2O54785 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Limk2O54785 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Limk2O54785 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Limk2O54785 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Limk2O54785 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Limk2O54785 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Limk2O54785 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms