Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bnc1O35914 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bnc1O35914 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bnc1O35914 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bnc1O35914 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bnc1O35914 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bnc1O35914 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bnc1O35914 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bnc1O35914 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bnc1O35914 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bnc1O35914 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bnc1O35914 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bnc1O35914 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bnc1O35914 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bnc1O35914 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bnc1O35914 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bnc1O35914 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bnc1O35914 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bnc1O35914 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bnc1O35914 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bnc1O35914 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bnc1O35914 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bnc1O35914 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Bnc1O35914 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bnc1O35914 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bnc1O35914 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bnc1O35914 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bnc1O35914 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bnc1O35914 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bnc1O35914 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bnc1O35914 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bnc1O35914 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bnc1O35914 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bnc1O35914 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bnc1O35914 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bnc1O35914 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bnc1O35914 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bnc1O35914 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bnc1O35914 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Bnc1O35914 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Bnc1O35914 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Bnc1O35914 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bnc1O35914 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bnc1O35914 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bnc1O35914 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bnc1O35914 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bnc1O35914 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bnc1O35914 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bnc1O35914 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bnc1O35914 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bnc1O35914 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bnc1O35914 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bnc1O35914 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bnc1O35914 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bnc1O35914 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bnc1O35914 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bnc1O35914 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bnc1O35914 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bnc1O35914 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bnc1O35914 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Bnc1O35914 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bnc1O35914 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bnc1O35914 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bnc1O35914 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bnc1O35914 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bnc1O35914 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bnc1O35914 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bnc1O35914 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bnc1O35914 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bnc1O35914 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bnc1O35914 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bnc1O35914 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bnc1O35914 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bnc1O35914 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bnc1O35914 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bnc1O35914 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bnc1O35914 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bnc1O35914 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bnc1O35914 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bnc1O35914 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bnc1O35914 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bnc1O35914 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Bnc1O35914 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bnc1O35914 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bnc1O35914 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bnc1O35914 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bnc1O35914 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Bnc1O35914 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bnc1O35914 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bnc1O35914 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Bnc1O35914 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bnc1O35914 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bnc1O35914 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bnc1O35914 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Bnc1O35914 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bnc1O35914 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bnc1O35914 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bnc1O35914 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bnc1O35914 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bnc1O35914 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms