Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TnxbO35452 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TnxbO35452 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TnxbO35452 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TnxbO35452 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TnxbO35452 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TnxbO35452 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TnxbO35452 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TnxbO35452 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TnxbO35452 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TnxbO35452 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TnxbO35452 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TnxbO35452 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TnxbO35452 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TnxbO35452 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TnxbO35452 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TnxbO35452 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TnxbO35452 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TnxbO35452 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TnxbO35452 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TnxbO35452 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TnxbO35452 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TnxbO35452 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TnxbO35452 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TnxbO35452 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TnxbO35452 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TnxbO35452 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TnxbO35452 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TnxbO35452 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TnxbO35452 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TnxbO35452 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TnxbO35452 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TnxbO35452 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TnxbO35452 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TnxbO35452 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TnxbO35452 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TnxbO35452 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TnxbO35452 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TnxbO35452 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TnxbO35452 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TnxbO35452 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TnxbO35452 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TnxbO35452 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TnxbO35452 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TnxbO35452 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TnxbO35452 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TnxbO35452 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TnxbO35452 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TnxbO35452 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TnxbO35452 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TnxbO35452 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TnxbO35452 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TnxbO35452 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TnxbO35452 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TnxbO35452 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TnxbO35452 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TnxbO35452 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TnxbO35452 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TnxbO35452 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TnxbO35452 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TnxbO35452 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TnxbO35452 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TnxbO35452 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TnxbO35452 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TnxbO35452 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TnxbO35452 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TnxbO35452 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TnxbO35452 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TnxbO35452 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TnxbO35452 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TnxbO35452 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TnxbO35452 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TnxbO35452 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TnxbO35452 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TnxbO35452 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TnxbO35452 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TnxbO35452 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TnxbO35452 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TnxbO35452 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TnxbO35452 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TnxbO35452 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TnxbO35452 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TnxbO35452 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TnxbO35452 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TnxbO35452 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TnxbO35452 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TnxbO35452 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TnxbO35452 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TnxbO35452 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TnxbO35452 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TnxbO35452 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TnxbO35452 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnxbO35452 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnxbO35452 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TnxbO35452 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TnxbO35452 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnxbO35452 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnxbO35452 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnxbO35452 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnxbO35452 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms