Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Pkd2O35245 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Pkd2O35245 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Pkd2O35245 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Pkd2O35245 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Pkd2O35245 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Pkd2O35245 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Pkd2O35245 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Pkd2O35245 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Pkd2O35245 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Pkd2O35245 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Pkd2O35245 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Pkd2O35245 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Pkd2O35245 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Pkd2O35245 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Pkd2O35245 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Pkd2O35245 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Pkd2O35245 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Pkd2O35245 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Pkd2O35245 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Pkd2O35245 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Pkd2O35245 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Pkd2O35245 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Pkd2O35245 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Pkd2O35245 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Pkd2O35245 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Pkd2O35245 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Pkd2O35245 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Pkd2O35245 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Pkd2O35245 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Pkd2O35245 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Pkd2O35245 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Pkd2O35245 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Pkd2O35245 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Pkd2O35245 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Pkd2O35245 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Pkd2O35245 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Pkd2O35245 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Pkd2O35245 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Pkd2O35245 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Pkd2O35245 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Pkd2O35245 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Pkd2O35245 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Pkd2O35245 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Pkd2O35245 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Pkd2O35245 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Pkd2O35245 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Pkd2O35245 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Pkd2O35245 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Pkd2O35245 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Pkd2O35245 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Pkd2O35245 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Pkd2O35245 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Pkd2O35245 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Pkd2O35245 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Pkd2O35245 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Pkd2O35245 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Pkd2O35245 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Pkd2O35245 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Pkd2O35245 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Pkd2O35245 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Pkd2O35245 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Pkd2O35245 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Pkd2O35245 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Pkd2O35245 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Pkd2O35245 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Pkd2O35245 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Pkd2O35245 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Pkd2O35245 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Pkd2O35245 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Pkd2O35245 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Pkd2O35245 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Pkd2O35245 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Pkd2O35245 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Pkd2O35245 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Pkd2O35245 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Pkd2O35245 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Pkd2O35245 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Pkd2O35245 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Pkd2O35245 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Pkd2O35245 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Pkd2O35245 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Pkd2O35245 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Pkd2O35245 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Pkd2O35245 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Pkd2O35245 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC33.82■■■■□ 3
Pkd2O35245 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Pkd2O35245 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Pkd2O35245 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Pkd2O35245 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Pkd2O35245 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Pkd2O35245 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Pkd2O35245 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Pkd2O35245 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Pkd2O35245 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Pkd2O35245 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Pkd2O35245 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Pkd2O35245 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Pkd2O35245 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Pkd2O35245 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms