Protein–RNA interactions for Protein: O09173

Hgd, Homogentisate 1,2-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HgdO09173 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HgdO09173 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HgdO09173 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HgdO09173 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HgdO09173 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HgdO09173 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HgdO09173 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HgdO09173 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HgdO09173 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HgdO09173 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HgdO09173 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HgdO09173 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HgdO09173 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HgdO09173 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HgdO09173 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HgdO09173 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HgdO09173 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HgdO09173 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HgdO09173 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HgdO09173 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HgdO09173 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HgdO09173 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HgdO09173 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HgdO09173 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HgdO09173 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HgdO09173 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HgdO09173 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HgdO09173 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HgdO09173 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HgdO09173 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HgdO09173 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HgdO09173 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HgdO09173 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HgdO09173 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HgdO09173 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HgdO09173 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HgdO09173 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HgdO09173 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HgdO09173 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HgdO09173 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HgdO09173 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HgdO09173 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HgdO09173 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HgdO09173 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HgdO09173 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HgdO09173 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HgdO09173 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HgdO09173 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HgdO09173 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HgdO09173 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HgdO09173 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HgdO09173 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HgdO09173 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HgdO09173 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HgdO09173 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HgdO09173 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HgdO09173 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HgdO09173 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HgdO09173 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HgdO09173 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HgdO09173 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HgdO09173 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HgdO09173 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HgdO09173 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HgdO09173 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HgdO09173 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HgdO09173 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HgdO09173 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HgdO09173 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HgdO09173 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HgdO09173 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HgdO09173 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HgdO09173 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HgdO09173 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HgdO09173 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HgdO09173 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HgdO09173 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HgdO09173 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HgdO09173 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HgdO09173 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HgdO09173 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HgdO09173 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HgdO09173 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HgdO09173 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HgdO09173 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HgdO09173 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HgdO09173 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HgdO09173 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HgdO09173 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HgdO09173 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HgdO09173 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HgdO09173 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HgdO09173 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HgdO09173 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HgdO09173 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HgdO09173 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HgdO09173 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HgdO09173 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HgdO09173 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HgdO09173 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms