Protein–RNA interactions for Protein: O09100

Gata2, Endothelial transcription factor GATA-2, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata2O09100 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gata2O09100 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gata2O09100 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gata2O09100 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gata2O09100 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gata2O09100 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gata2O09100 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gata2O09100 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gata2O09100 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gata2O09100 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gata2O09100 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gata2O09100 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gata2O09100 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gata2O09100 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gata2O09100 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gata2O09100 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gata2O09100 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gata2O09100 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gata2O09100 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gata2O09100 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gata2O09100 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gata2O09100 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gata2O09100 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gata2O09100 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gata2O09100 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gata2O09100 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gata2O09100 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gata2O09100 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gata2O09100 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gata2O09100 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gata2O09100 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gata2O09100 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata2O09100 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata2O09100 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata2O09100 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata2O09100 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata2O09100 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata2O09100 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata2O09100 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata2O09100 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata2O09100 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata2O09100 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata2O09100 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata2O09100 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata2O09100 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata2O09100 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata2O09100 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata2O09100 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata2O09100 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gata2O09100 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gata2O09100 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gata2O09100 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gata2O09100 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gata2O09100 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gata2O09100 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gata2O09100 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gata2O09100 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gata2O09100 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gata2O09100 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gata2O09100 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gata2O09100 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gata2O09100 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gata2O09100 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gata2O09100 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gata2O09100 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gata2O09100 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gata2O09100 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gata2O09100 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gata2O09100 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gata2O09100 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gata2O09100 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gata2O09100 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gata2O09100 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gata2O09100 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gata2O09100 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gata2O09100 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gata2O09100 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gata2O09100 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gata2O09100 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gata2O09100 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gata2O09100 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gata2O09100 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gata2O09100 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gata2O09100 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gata2O09100 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gata2O09100 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gata2O09100 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gata2O09100 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gata2O09100 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gata2O09100 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gata2O09100 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gata2O09100 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gata2O09100 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gata2O09100 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gata2O09100 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gata2O09100 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gata2O09100 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gata2O09100 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gata2O09100 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gata2O09100 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms