Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
PbsnO08976 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23,95■■□□□ 1,42
PbsnO08976 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
PbsnO08976 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,93■■□□□ 1,42
PbsnO08976 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,93■■□□□ 1,42
PbsnO08976 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23,92■■□□□ 1,42
PbsnO08976 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
PbsnO08976 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
PbsnO08976 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
PbsnO08976 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
PbsnO08976 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
PbsnO08976 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
PbsnO08976 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
PbsnO08976 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23,9■■□□□ 1,42
PbsnO08976 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,9■■□□□ 1,42
PbsnO08976 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,42
PbsnO08976 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,41
PbsnO08976 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,41
PbsnO08976 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23,88■■□□□ 1,41
PbsnO08976 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
PbsnO08976 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23,85■■□□□ 1,41
PbsnO08976 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23,85■■□□□ 1,41
PbsnO08976 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23,85■■□□□ 1,41
PbsnO08976 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
PbsnO08976 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
PbsnO08976 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,84■■□□□ 1,41
PbsnO08976 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23,84■■□□□ 1,41
PbsnO08976 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
PbsnO08976 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
PbsnO08976 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
PbsnO08976 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,4
PbsnO08976 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
PbsnO08976 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
PbsnO08976 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
PbsnO08976 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
PbsnO08976 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
PbsnO08976 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
PbsnO08976 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
PbsnO08976 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
PbsnO08976 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,78■■□□□ 1,4
PbsnO08976 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
PbsnO08976 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
PbsnO08976 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,77■■□□□ 1,4
PbsnO08976 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
PbsnO08976 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
PbsnO08976 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
PbsnO08976 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
PbsnO08976 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,75■■□□□ 1,39
PbsnO08976 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
PbsnO08976 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23,74■■□□□ 1,39
PbsnO08976 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23,73■■□□□ 1,39
PbsnO08976 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
PbsnO08976 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23,72■■□□□ 1,39
PbsnO08976 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
PbsnO08976 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
PbsnO08976 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
PbsnO08976 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
PbsnO08976 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
PbsnO08976 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23,69■■□□□ 1,38
PbsnO08976 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
PbsnO08976 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
PbsnO08976 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23,67■■□□□ 1,38
PbsnO08976 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
PbsnO08976 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23,66■■□□□ 1,38
PbsnO08976 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23,66■■□□□ 1,38
PbsnO08976 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
PbsnO08976 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23,65■■□□□ 1,38
PbsnO08976 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
PbsnO08976 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,64■■□□□ 1,38
PbsnO08976 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
PbsnO08976 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,64■■□□□ 1,37
PbsnO08976 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,63■■□□□ 1,37
PbsnO08976 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23,63■■□□□ 1,37
PbsnO08976 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,63■■□□□ 1,37
PbsnO08976 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
PbsnO08976 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
PbsnO08976 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23,62■■□□□ 1,37
PbsnO08976 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
PbsnO08976 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23,61■■□□□ 1,37
PbsnO08976 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
PbsnO08976 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
PbsnO08976 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23,6■■□□□ 1,37
PbsnO08976 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,6■■□□□ 1,37
PbsnO08976 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23,6■■□□□ 1,37
PbsnO08976 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,6■■□□□ 1,37
PbsnO08976 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
PbsnO08976 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
PbsnO08976 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23,59■■□□□ 1,37
PbsnO08976 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
PbsnO08976 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,58■■□□□ 1,37
PbsnO08976 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
PbsnO08976 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
PbsnO08976 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
PbsnO08976 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23,57■■□□□ 1,36
PbsnO08976 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
PbsnO08976 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
PbsnO08976 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
PbsnO08976 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,56■■□□□ 1,36
PbsnO08976 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
PbsnO08976 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,56■■□□□ 1,36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,4 ms