Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gfra2O08842 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gfra2O08842 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gfra2O08842 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gfra2O08842 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gfra2O08842 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gfra2O08842 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gfra2O08842 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gfra2O08842 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gfra2O08842 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gfra2O08842 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gfra2O08842 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gfra2O08842 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gfra2O08842 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gfra2O08842 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gfra2O08842 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gfra2O08842 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gfra2O08842 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gfra2O08842 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gfra2O08842 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gfra2O08842 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gfra2O08842 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gfra2O08842 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gfra2O08842 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gfra2O08842 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gfra2O08842 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gfra2O08842 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gfra2O08842 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gfra2O08842 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gfra2O08842 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gfra2O08842 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gfra2O08842 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gfra2O08842 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gfra2O08842 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gfra2O08842 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gfra2O08842 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gfra2O08842 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gfra2O08842 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gfra2O08842 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gfra2O08842 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gfra2O08842 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gfra2O08842 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gfra2O08842 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gfra2O08842 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gfra2O08842 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gfra2O08842 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gfra2O08842 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gfra2O08842 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gfra2O08842 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gfra2O08842 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gfra2O08842 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gfra2O08842 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gfra2O08842 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gfra2O08842 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gfra2O08842 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gfra2O08842 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gfra2O08842 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gfra2O08842 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gfra2O08842 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gfra2O08842 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gfra2O08842 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gfra2O08842 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gfra2O08842 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gfra2O08842 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gfra2O08842 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gfra2O08842 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gfra2O08842 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gfra2O08842 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gfra2O08842 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gfra2O08842 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gfra2O08842 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gfra2O08842 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gfra2O08842 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gfra2O08842 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gfra2O08842 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Gfra2O08842 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Gfra2O08842 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gfra2O08842 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gfra2O08842 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gfra2O08842 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gfra2O08842 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gfra2O08842 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gfra2O08842 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gfra2O08842 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gfra2O08842 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gfra2O08842 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gfra2O08842 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gfra2O08842 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gfra2O08842 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gfra2O08842 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gfra2O08842 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gfra2O08842 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gfra2O08842 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gfra2O08842 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gfra2O08842 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gfra2O08842 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gfra2O08842 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gfra2O08842 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gfra2O08842 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gfra2O08842 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms