Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ube3aO08759 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ube3aO08759 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ube3aO08759 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ube3aO08759 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ube3aO08759 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ube3aO08759 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ube3aO08759 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ube3aO08759 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ube3aO08759 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ube3aO08759 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ube3aO08759 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ube3aO08759 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ube3aO08759 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ube3aO08759 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ube3aO08759 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ube3aO08759 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ube3aO08759 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ube3aO08759 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ube3aO08759 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ube3aO08759 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ube3aO08759 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ube3aO08759 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ube3aO08759 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ube3aO08759 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ube3aO08759 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ube3aO08759 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ube3aO08759 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ube3aO08759 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ube3aO08759 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ube3aO08759 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ube3aO08759 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ube3aO08759 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ube3aO08759 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ube3aO08759 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ube3aO08759 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ube3aO08759 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ube3aO08759 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ube3aO08759 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ube3aO08759 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ube3aO08759 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ube3aO08759 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ube3aO08759 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ube3aO08759 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ube3aO08759 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ube3aO08759 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ube3aO08759 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ube3aO08759 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ube3aO08759 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ube3aO08759 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ube3aO08759 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ube3aO08759 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ube3aO08759 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ube3aO08759 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ube3aO08759 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ube3aO08759 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ube3aO08759 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ube3aO08759 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ube3aO08759 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ube3aO08759 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ube3aO08759 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ube3aO08759 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ube3aO08759 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ube3aO08759 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ube3aO08759 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ube3aO08759 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ube3aO08759 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ube3aO08759 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ube3aO08759 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ube3aO08759 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ube3aO08759 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube3aO08759 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube3aO08759 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube3aO08759 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ube3aO08759 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ube3aO08759 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ube3aO08759 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ube3aO08759 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ube3aO08759 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ube3aO08759 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ube3aO08759 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ube3aO08759 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ube3aO08759 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ube3aO08759 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ube3aO08759 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ube3aO08759 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ube3aO08759 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ube3aO08759 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ube3aO08759 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ube3aO08759 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ube3aO08759 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ube3aO08759 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ube3aO08759 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ube3aO08759 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ube3aO08759 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ube3aO08759 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ube3aO08759 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ube3aO08759 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ube3aO08759 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ube3aO08759 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms