Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Barx2O08686 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Barx2O08686 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Barx2O08686 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Barx2O08686 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Barx2O08686 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Barx2O08686 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Barx2O08686 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Barx2O08686 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Barx2O08686 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Barx2O08686 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Barx2O08686 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Barx2O08686 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Barx2O08686 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Barx2O08686 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Barx2O08686 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Barx2O08686 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Barx2O08686 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Barx2O08686 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Barx2O08686 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Barx2O08686 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Barx2O08686 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Barx2O08686 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Barx2O08686 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Barx2O08686 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Barx2O08686 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Barx2O08686 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Barx2O08686 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Barx2O08686 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Barx2O08686 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Barx2O08686 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Barx2O08686 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Barx2O08686 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Barx2O08686 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Barx2O08686 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Barx2O08686 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Barx2O08686 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Barx2O08686 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Barx2O08686 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Barx2O08686 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Barx2O08686 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Barx2O08686 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Barx2O08686 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Barx2O08686 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Barx2O08686 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Barx2O08686 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Barx2O08686 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Barx2O08686 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Barx2O08686 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Barx2O08686 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Barx2O08686 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Barx2O08686 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Barx2O08686 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Barx2O08686 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Barx2O08686 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Barx2O08686 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Barx2O08686 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Barx2O08686 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Barx2O08686 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Barx2O08686 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Barx2O08686 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Barx2O08686 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Barx2O08686 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Barx2O08686 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Barx2O08686 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Barx2O08686 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Barx2O08686 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Barx2O08686 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Barx2O08686 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Barx2O08686 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Barx2O08686 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Barx2O08686 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Barx2O08686 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Barx2O08686 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Barx2O08686 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Barx2O08686 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Barx2O08686 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Barx2O08686 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Barx2O08686 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Barx2O08686 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Barx2O08686 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Barx2O08686 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Barx2O08686 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Barx2O08686 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Barx2O08686 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Barx2O08686 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Barx2O08686 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Barx2O08686 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Barx2O08686 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Barx2O08686 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Barx2O08686 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Barx2O08686 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Barx2O08686 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Barx2O08686 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Barx2O08686 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Barx2O08686 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Barx2O08686 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Barx2O08686 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Barx2O08686 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Barx2O08686 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.1 ms