Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema3aO08665 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema3aO08665 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema3aO08665 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema3aO08665 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema3aO08665 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema3aO08665 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema3aO08665 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema3aO08665 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema3aO08665 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sema3aO08665 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sema3aO08665 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sema3aO08665 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sema3aO08665 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sema3aO08665 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema3aO08665 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema3aO08665 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema3aO08665 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema3aO08665 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema3aO08665 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema3aO08665 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema3aO08665 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema3aO08665 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema3aO08665 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema3aO08665 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema3aO08665 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sema3aO08665 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sema3aO08665 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema3aO08665 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema3aO08665 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema3aO08665 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema3aO08665 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema3aO08665 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema3aO08665 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema3aO08665 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema3aO08665 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema3aO08665 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema3aO08665 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema3aO08665 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema3aO08665 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema3aO08665 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema3aO08665 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema3aO08665 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema3aO08665 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema3aO08665 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema3aO08665 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema3aO08665 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema3aO08665 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema3aO08665 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema3aO08665 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema3aO08665 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema3aO08665 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema3aO08665 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema3aO08665 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema3aO08665 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema3aO08665 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema3aO08665 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema3aO08665 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema3aO08665 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema3aO08665 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema3aO08665 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema3aO08665 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema3aO08665 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema3aO08665 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema3aO08665 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema3aO08665 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema3aO08665 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema3aO08665 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema3aO08665 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema3aO08665 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema3aO08665 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema3aO08665 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema3aO08665 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema3aO08665 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema3aO08665 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema3aO08665 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema3aO08665 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema3aO08665 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema3aO08665 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema3aO08665 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema3aO08665 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema3aO08665 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sema3aO08665 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sema3aO08665 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sema3aO08665 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sema3aO08665 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sema3aO08665 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema3aO08665 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema3aO08665 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema3aO08665 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema3aO08665 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema3aO08665 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema3aO08665 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema3aO08665 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema3aO08665 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema3aO08665 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema3aO08665 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema3aO08665 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema3aO08665 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema3aO08665 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms