Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cacna2d1O08532 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cacna2d1O08532 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacna2d1O08532 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacna2d1O08532 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacna2d1O08532 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna2d1O08532 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna2d1O08532 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna2d1O08532 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna2d1O08532 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna2d1O08532 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cacna2d1O08532 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cacna2d1O08532 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cacna2d1O08532 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna2d1O08532 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna2d1O08532 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna2d1O08532 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna2d1O08532 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacna2d1O08532 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna2d1O08532 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna2d1O08532 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna2d1O08532 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacna2d1O08532 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacna2d1O08532 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacna2d1O08532 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacna2d1O08532 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacna2d1O08532 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacna2d1O08532 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacna2d1O08532 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cacna2d1O08532 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cacna2d1O08532 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacna2d1O08532 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacna2d1O08532 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacna2d1O08532 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cacna2d1O08532 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacna2d1O08532 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacna2d1O08532 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacna2d1O08532 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacna2d1O08532 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacna2d1O08532 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna2d1O08532 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna2d1O08532 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cacna2d1O08532 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cacna2d1O08532 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cacna2d1O08532 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cacna2d1O08532 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cacna2d1O08532 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cacna2d1O08532 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna2d1O08532 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna2d1O08532 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna2d1O08532 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna2d1O08532 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacna2d1O08532 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacna2d1O08532 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacna2d1O08532 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacna2d1O08532 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacna2d1O08532 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cacna2d1O08532 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacna2d1O08532 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacna2d1O08532 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacna2d1O08532 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacna2d1O08532 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacna2d1O08532 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna2d1O08532 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna2d1O08532 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna2d1O08532 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna2d1O08532 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna2d1O08532 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna2d1O08532 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna2d1O08532 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacna2d1O08532 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacna2d1O08532 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacna2d1O08532 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacna2d1O08532 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacna2d1O08532 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cacna2d1O08532 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cacna2d1O08532 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cacna2d1O08532 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cacna2d1O08532 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacna2d1O08532 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacna2d1O08532 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacna2d1O08532 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacna2d1O08532 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacna2d1O08532 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacna2d1O08532 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacna2d1O08532 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacna2d1O08532 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacna2d1O08532 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacna2d1O08532 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna2d1O08532 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna2d1O08532 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacna2d1O08532 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacna2d1O08532 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacna2d1O08532 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacna2d1O08532 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacna2d1O08532 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacna2d1O08532 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacna2d1O08532 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacna2d1O08532 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacna2d1O08532 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms