Protein–RNA interactions for Protein: O08529

Capn2, Calpain-2 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn2O08529 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Capn2O08529 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Capn2O08529 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Capn2O08529 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Capn2O08529 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Capn2O08529 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Capn2O08529 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Capn2O08529 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Capn2O08529 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Capn2O08529 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Capn2O08529 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Capn2O08529 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Capn2O08529 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Capn2O08529 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Capn2O08529 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Capn2O08529 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Capn2O08529 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Capn2O08529 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Capn2O08529 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Capn2O08529 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Capn2O08529 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Capn2O08529 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Capn2O08529 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Capn2O08529 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Capn2O08529 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Capn2O08529 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Capn2O08529 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Capn2O08529 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Capn2O08529 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Capn2O08529 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Capn2O08529 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Capn2O08529 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Capn2O08529 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Capn2O08529 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Capn2O08529 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Capn2O08529 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Capn2O08529 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Capn2O08529 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Capn2O08529 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Capn2O08529 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Capn2O08529 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Capn2O08529 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Capn2O08529 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Capn2O08529 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Capn2O08529 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Capn2O08529 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Capn2O08529 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Capn2O08529 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Capn2O08529 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Capn2O08529 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Capn2O08529 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Capn2O08529 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Capn2O08529 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Capn2O08529 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Capn2O08529 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Capn2O08529 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Capn2O08529 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Capn2O08529 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Capn2O08529 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Capn2O08529 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Capn2O08529 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Capn2O08529 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Capn2O08529 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Capn2O08529 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Capn2O08529 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Capn2O08529 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Capn2O08529 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Capn2O08529 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Capn2O08529 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Capn2O08529 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Capn2O08529 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Capn2O08529 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Capn2O08529 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Capn2O08529 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Capn2O08529 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Capn2O08529 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Capn2O08529 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Capn2O08529 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Capn2O08529 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Capn2O08529 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Capn2O08529 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Capn2O08529 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Capn2O08529 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Capn2O08529 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Capn2O08529 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Capn2O08529 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Capn2O08529 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Capn2O08529 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Capn2O08529 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Capn2O08529 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Capn2O08529 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Capn2O08529 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Capn2O08529 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Capn2O08529 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Capn2O08529 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Capn2O08529 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Capn2O08529 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Capn2O08529 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Capn2O08529 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Capn2O08529 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms