Protein–RNA interactions for Protein: K7N721

Gm3248, Predicted gene 3248, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3248K7N721 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3248K7N721 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3248K7N721 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3248K7N721 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3248K7N721 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm3248K7N721 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm3248K7N721 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3248K7N721 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3248K7N721 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm3248K7N721 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3248K7N721 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3248K7N721 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3248K7N721 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3248K7N721 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3248K7N721 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3248K7N721 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3248K7N721 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3248K7N721 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3248K7N721 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3248K7N721 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3248K7N721 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3248K7N721 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3248K7N721 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3248K7N721 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3248K7N721 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm3248K7N721 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm3248K7N721 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3248K7N721 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3248K7N721 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3248K7N721 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3248K7N721 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3248K7N721 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3248K7N721 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3248K7N721 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3248K7N721 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3248K7N721 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3248K7N721 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3248K7N721 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3248K7N721 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3248K7N721 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3248K7N721 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3248K7N721 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3248K7N721 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3248K7N721 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3248K7N721 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3248K7N721 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3248K7N721 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3248K7N721 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3248K7N721 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3248K7N721 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3248K7N721 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3248K7N721 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3248K7N721 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3248K7N721 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3248K7N721 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3248K7N721 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3248K7N721 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3248K7N721 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3248K7N721 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3248K7N721 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3248K7N721 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3248K7N721 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3248K7N721 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3248K7N721 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3248K7N721 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3248K7N721 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3248K7N721 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3248K7N721 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3248K7N721 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3248K7N721 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3248K7N721 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3248K7N721 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3248K7N721 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3248K7N721 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3248K7N721 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3248K7N721 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3248K7N721 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3248K7N721 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3248K7N721 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3248K7N721 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3248K7N721 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3248K7N721 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3248K7N721 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3248K7N721 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3248K7N721 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3248K7N721 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3248K7N721 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3248K7N721 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3248K7N721 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3248K7N721 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3248K7N721 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3248K7N721 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3248K7N721 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3248K7N721 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3248K7N721 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3248K7N721 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3248K7N721 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3248K7N721 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3248K7N721 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3248K7N721 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.4 ms