Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U5

Vmn2r78, Vomeronasal 2, receptor 78, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r78K7N6U5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vmn2r78K7N6U5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vmn2r78K7N6U5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vmn2r78K7N6U5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vmn2r78K7N6U5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vmn2r78K7N6U5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vmn2r78K7N6U5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vmn2r78K7N6U5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vmn2r78K7N6U5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vmn2r78K7N6U5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vmn2r78K7N6U5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vmn2r78K7N6U5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vmn2r78K7N6U5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vmn2r78K7N6U5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vmn2r78K7N6U5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vmn2r78K7N6U5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vmn2r78K7N6U5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vmn2r78K7N6U5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vmn2r78K7N6U5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vmn2r78K7N6U5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vmn2r78K7N6U5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vmn2r78K7N6U5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vmn2r78K7N6U5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vmn2r78K7N6U5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vmn2r78K7N6U5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vmn2r78K7N6U5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vmn2r78K7N6U5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vmn2r78K7N6U5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vmn2r78K7N6U5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vmn2r78K7N6U5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vmn2r78K7N6U5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vmn2r78K7N6U5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vmn2r78K7N6U5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Vmn2r78K7N6U5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vmn2r78K7N6U5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vmn2r78K7N6U5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vmn2r78K7N6U5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vmn2r78K7N6U5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vmn2r78K7N6U5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vmn2r78K7N6U5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vmn2r78K7N6U5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vmn2r78K7N6U5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vmn2r78K7N6U5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vmn2r78K7N6U5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vmn2r78K7N6U5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vmn2r78K7N6U5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vmn2r78K7N6U5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vmn2r78K7N6U5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vmn2r78K7N6U5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Vmn2r78K7N6U5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vmn2r78K7N6U5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vmn2r78K7N6U5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Vmn2r78K7N6U5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vmn2r78K7N6U5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vmn2r78K7N6U5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vmn2r78K7N6U5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vmn2r78K7N6U5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vmn2r78K7N6U5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vmn2r78K7N6U5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vmn2r78K7N6U5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vmn2r78K7N6U5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vmn2r78K7N6U5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vmn2r78K7N6U5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vmn2r78K7N6U5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vmn2r78K7N6U5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vmn2r78K7N6U5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vmn2r78K7N6U5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vmn2r78K7N6U5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vmn2r78K7N6U5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vmn2r78K7N6U5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vmn2r78K7N6U5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vmn2r78K7N6U5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vmn2r78K7N6U5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vmn2r78K7N6U5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vmn2r78K7N6U5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vmn2r78K7N6U5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vmn2r78K7N6U5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vmn2r78K7N6U5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vmn2r78K7N6U5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vmn2r78K7N6U5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Vmn2r78K7N6U5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Vmn2r78K7N6U5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Vmn2r78K7N6U5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vmn2r78K7N6U5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vmn2r78K7N6U5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vmn2r78K7N6U5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vmn2r78K7N6U5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vmn2r78K7N6U5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vmn2r78K7N6U5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Vmn2r78K7N6U5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Vmn2r78K7N6U5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vmn2r78K7N6U5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vmn2r78K7N6U5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vmn2r78K7N6U5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Vmn2r78K7N6U5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vmn2r78K7N6U5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vmn2r78K7N6U5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vmn2r78K7N6U5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vmn2r78K7N6U5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vmn2r78K7N6U5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms