Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD5

Gm9602, Predicted gene 9602, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9602J3QPD5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm9602J3QPD5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm9602J3QPD5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm9602J3QPD5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm9602J3QPD5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm9602J3QPD5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm9602J3QPD5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm9602J3QPD5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm9602J3QPD5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm9602J3QPD5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm9602J3QPD5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm9602J3QPD5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm9602J3QPD5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm9602J3QPD5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm9602J3QPD5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm9602J3QPD5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm9602J3QPD5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm9602J3QPD5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm9602J3QPD5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm9602J3QPD5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm9602J3QPD5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm9602J3QPD5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm9602J3QPD5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm9602J3QPD5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm9602J3QPD5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm9602J3QPD5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm9602J3QPD5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm9602J3QPD5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm9602J3QPD5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm9602J3QPD5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm9602J3QPD5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm9602J3QPD5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm9602J3QPD5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm9602J3QPD5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm9602J3QPD5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm9602J3QPD5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm9602J3QPD5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm9602J3QPD5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm9602J3QPD5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm9602J3QPD5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm9602J3QPD5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm9602J3QPD5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm9602J3QPD5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm9602J3QPD5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm9602J3QPD5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm9602J3QPD5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm9602J3QPD5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm9602J3QPD5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm9602J3QPD5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm9602J3QPD5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm9602J3QPD5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm9602J3QPD5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm9602J3QPD5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm9602J3QPD5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm9602J3QPD5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm9602J3QPD5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm9602J3QPD5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm9602J3QPD5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm9602J3QPD5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm9602J3QPD5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm9602J3QPD5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm9602J3QPD5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm9602J3QPD5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms