Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mfsd4b4J3QNS5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mfsd4b4J3QNS5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mfsd4b4J3QNS5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mfsd4b4J3QNS5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mfsd4b4J3QNS5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mfsd4b4J3QNS5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mfsd4b4J3QNS5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mfsd4b4J3QNS5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mfsd4b4J3QNS5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mfsd4b4J3QNS5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mfsd4b4J3QNS5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mfsd4b4J3QNS5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mfsd4b4J3QNS5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mfsd4b4J3QNS5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mfsd4b4J3QNS5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mfsd4b4J3QNS5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mfsd4b4J3QNS5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mfsd4b4J3QNS5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mfsd4b4J3QNS5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mfsd4b4J3QNS5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mfsd4b4J3QNS5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mfsd4b4J3QNS5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mfsd4b4J3QNS5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mfsd4b4J3QNS5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mfsd4b4J3QNS5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Mfsd4b4J3QNS5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Mfsd4b4J3QNS5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mfsd4b4J3QNS5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mfsd4b4J3QNS5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mfsd4b4J3QNS5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mfsd4b4J3QNS5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mfsd4b4J3QNS5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mfsd4b4J3QNS5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mfsd4b4J3QNS5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mfsd4b4J3QNS5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mfsd4b4J3QNS5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mfsd4b4J3QNS5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mfsd4b4J3QNS5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mfsd4b4J3QNS5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mfsd4b4J3QNS5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mfsd4b4J3QNS5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mfsd4b4J3QNS5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mfsd4b4J3QNS5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Mfsd4b4J3QNS5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mfsd4b4J3QNS5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mfsd4b4J3QNS5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mfsd4b4J3QNS5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mfsd4b4J3QNS5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mfsd4b4J3QNS5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mfsd4b4J3QNS5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mfsd4b4J3QNS5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mfsd4b4J3QNS5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mfsd4b4J3QNS5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mfsd4b4J3QNS5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mfsd4b4J3QNS5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mfsd4b4J3QNS5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mfsd4b4J3QNS5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mfsd4b4J3QNS5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mfsd4b4J3QNS5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mfsd4b4J3QNS5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mfsd4b4J3QNS5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mfsd4b4J3QNS5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mfsd4b4J3QNS5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mfsd4b4J3QNS5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mfsd4b4J3QNS5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Mfsd4b4J3QNS5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mfsd4b4J3QNS5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mfsd4b4J3QNS5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mfsd4b4J3QNS5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mfsd4b4J3QNS5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mfsd4b4J3QNS5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mfsd4b4J3QNS5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mfsd4b4J3QNS5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mfsd4b4J3QNS5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mfsd4b4J3QNS5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mfsd4b4J3QNS5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mfsd4b4J3QNS5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mfsd4b4J3QNS5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mfsd4b4J3QNS5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Mfsd4b4J3QNS5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mfsd4b4J3QNS5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mfsd4b4J3QNS5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mfsd4b4J3QNS5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mfsd4b4J3QNS5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mfsd4b4J3QNS5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mfsd4b4J3QNS5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mfsd4b4J3QNS5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mfsd4b4J3QNS5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Mfsd4b4J3QNS5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mfsd4b4J3QNS5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mfsd4b4J3QNS5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Mfsd4b4J3QNS5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mfsd4b4J3QNS5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mfsd4b4J3QNS5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mfsd4b4J3QNS5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mfsd4b4J3QNS5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mfsd4b4J3QNS5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mfsd4b4J3QNS5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 437.6 ms