Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20918J3QN17 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20918J3QN17 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20918J3QN17 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20918J3QN17 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20918J3QN17 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20918J3QN17 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20918J3QN17 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20918J3QN17 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20918J3QN17 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20918J3QN17 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20918J3QN17 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20918J3QN17 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20918J3QN17 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20918J3QN17 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20918J3QN17 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20918J3QN17 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20918J3QN17 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20918J3QN17 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20918J3QN17 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20918J3QN17 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20918J3QN17 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20918J3QN17 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20918J3QN17 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20918J3QN17 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20918J3QN17 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20918J3QN17 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20918J3QN17 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20918J3QN17 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20918J3QN17 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20918J3QN17 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20918J3QN17 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20918J3QN17 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20918J3QN17 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20918J3QN17 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20918J3QN17 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20918J3QN17 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20918J3QN17 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20918J3QN17 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20918J3QN17 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20918J3QN17 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20918J3QN17 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20918J3QN17 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20918J3QN17 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20918J3QN17 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20918J3QN17 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20918J3QN17 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20918J3QN17 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20918J3QN17 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20918J3QN17 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20918J3QN17 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20918J3QN17 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20918J3QN17 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20918J3QN17 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20918J3QN17 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20918J3QN17 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20918J3QN17 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20918J3QN17 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20918J3QN17 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20918J3QN17 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20918J3QN17 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20918J3QN17 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20918J3QN17 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20918J3QN17 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20918J3QN17 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20918J3QN17 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20918J3QN17 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20918J3QN17 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20918J3QN17 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20918J3QN17 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20918J3QN17 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20918J3QN17 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20918J3QN17 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20918J3QN17 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20918J3QN17 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20918J3QN17 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20918J3QN17 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20918J3QN17 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20918J3QN17 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20918J3QN17 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20918J3QN17 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20918J3QN17 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm20918J3QN17 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm20918J3QN17 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm20918J3QN17 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20918J3QN17 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20918J3QN17 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20918J3QN17 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20918J3QN17 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20918J3QN17 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20918J3QN17 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20918J3QN17 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20918J3QN17 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20918J3QN17 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20918J3QN17 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20918J3QN17 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20918J3QN17 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20918J3QN17 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20918J3QN17 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20918J3QN17 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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