Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm20834J3QM72 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm20834J3QM72 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20834J3QM72 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20834J3QM72 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20834J3QM72 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20834J3QM72 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20834J3QM72 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20834J3QM72 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20834J3QM72 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20834J3QM72 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20834J3QM72 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20834J3QM72 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20834J3QM72 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20834J3QM72 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm20834J3QM72 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20834J3QM72 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20834J3QM72 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20834J3QM72 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm20834J3QM72 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm20834J3QM72 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm20834J3QM72 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20834J3QM72 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20834J3QM72 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20834J3QM72 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20834J3QM72 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20834J3QM72 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20834J3QM72 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20834J3QM72 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20834J3QM72 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20834J3QM72 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20834J3QM72 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20834J3QM72 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20834J3QM72 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20834J3QM72 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20834J3QM72 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20834J3QM72 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20834J3QM72 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20834J3QM72 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm20834J3QM72 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm20834J3QM72 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm20834J3QM72 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm20834J3QM72 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20834J3QM72 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20834J3QM72 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20834J3QM72 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20834J3QM72 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20834J3QM72 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm20834J3QM72 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm20834J3QM72 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20834J3QM72 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20834J3QM72 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20834J3QM72 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20834J3QM72 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20834J3QM72 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20834J3QM72 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20834J3QM72 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20834J3QM72 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20834J3QM72 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20834J3QM72 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20834J3QM72 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20834J3QM72 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20834J3QM72 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20834J3QM72 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20834J3QM72 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20834J3QM72 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20834J3QM72 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20834J3QM72 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20834J3QM72 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20834J3QM72 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20834J3QM72 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20834J3QM72 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20834J3QM72 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20834J3QM72 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20834J3QM72 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20834J3QM72 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20834J3QM72 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20834J3QM72 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20834J3QM72 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20834J3QM72 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20834J3QM72 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20834J3QM72 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20834J3QM72 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm20834J3QM72 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm20834J3QM72 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20834J3QM72 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20834J3QM72 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20834J3QM72 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20834J3QM72 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20834J3QM72 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20834J3QM72 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20834J3QM72 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20834J3QM72 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20834J3QM72 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20834J3QM72 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20834J3QM72 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20834J3QM72 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20834J3QM72 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20834J3QM72 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20834J3QM72 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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