Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zfp408H7BX78 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zfp408H7BX78 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zfp408H7BX78 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zfp408H7BX78 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zfp408H7BX78 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Zfp408H7BX78 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zfp408H7BX78 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zfp408H7BX78 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zfp408H7BX78 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zfp408H7BX78 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zfp408H7BX78 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zfp408H7BX78 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zfp408H7BX78 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zfp408H7BX78 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp408H7BX78 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp408H7BX78 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp408H7BX78 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp408H7BX78 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zfp408H7BX78 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zfp408H7BX78 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zfp408H7BX78 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zfp408H7BX78 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zfp408H7BX78 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zfp408H7BX78 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zfp408H7BX78 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zfp408H7BX78 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zfp408H7BX78 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zfp408H7BX78 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zfp408H7BX78 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zfp408H7BX78 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zfp408H7BX78 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zfp408H7BX78 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zfp408H7BX78 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zfp408H7BX78 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zfp408H7BX78 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zfp408H7BX78 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zfp408H7BX78 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zfp408H7BX78 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zfp408H7BX78 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zfp408H7BX78 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zfp408H7BX78 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zfp408H7BX78 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zfp408H7BX78 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zfp408H7BX78 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zfp408H7BX78 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp408H7BX78 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp408H7BX78 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp408H7BX78 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp408H7BX78 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfp408H7BX78 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfp408H7BX78 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfp408H7BX78 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfp408H7BX78 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfp408H7BX78 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zfp408H7BX78 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zfp408H7BX78 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zfp408H7BX78 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zfp408H7BX78 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zfp408H7BX78 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zfp408H7BX78 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zfp408H7BX78 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zfp408H7BX78 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zfp408H7BX78 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zfp408H7BX78 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zfp408H7BX78 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zfp408H7BX78 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zfp408H7BX78 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zfp408H7BX78 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zfp408H7BX78 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zfp408H7BX78 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zfp408H7BX78 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zfp408H7BX78 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zfp408H7BX78 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zfp408H7BX78 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zfp408H7BX78 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Zfp408H7BX78 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zfp408H7BX78 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Zfp408H7BX78 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zfp408H7BX78 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zfp408H7BX78 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zfp408H7BX78 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Zfp408H7BX78 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Zfp408H7BX78 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zfp408H7BX78 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zfp408H7BX78 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zfp408H7BX78 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zfp408H7BX78 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Zfp408H7BX78 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Zfp408H7BX78 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zfp408H7BX78 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zfp408H7BX78 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zfp408H7BX78 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zfp408H7BX78 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zfp408H7BX78 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Zfp408H7BX78 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zfp408H7BX78 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zfp408H7BX78 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zfp408H7BX78 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zfp408H7BX78 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms