Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r12G5E8G1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r12G5E8G1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r12G5E8G1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r12G5E8G1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r12G5E8G1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r12G5E8G1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r12G5E8G1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r12G5E8G1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r12G5E8G1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r12G5E8G1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r12G5E8G1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r12G5E8G1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r12G5E8G1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r12G5E8G1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r12G5E8G1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r12G5E8G1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r12G5E8G1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r12G5E8G1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r12G5E8G1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r12G5E8G1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r12G5E8G1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r12G5E8G1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r12G5E8G1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r12G5E8G1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r12G5E8G1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r12G5E8G1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vmn1r12G5E8G1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vmn1r12G5E8G1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r12G5E8G1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r12G5E8G1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r12G5E8G1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r12G5E8G1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r12G5E8G1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r12G5E8G1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r12G5E8G1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r12G5E8G1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r12G5E8G1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r12G5E8G1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r12G5E8G1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r12G5E8G1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r12G5E8G1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r12G5E8G1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r12G5E8G1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r12G5E8G1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r12G5E8G1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r12G5E8G1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r12G5E8G1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r12G5E8G1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r12G5E8G1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r12G5E8G1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r12G5E8G1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r12G5E8G1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r12G5E8G1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r12G5E8G1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r12G5E8G1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r12G5E8G1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn1r12G5E8G1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn1r12G5E8G1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn1r12G5E8G1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn1r12G5E8G1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r12G5E8G1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r12G5E8G1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r12G5E8G1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r12G5E8G1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r12G5E8G1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r12G5E8G1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r12G5E8G1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r12G5E8G1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r12G5E8G1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r12G5E8G1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r12G5E8G1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r12G5E8G1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r12G5E8G1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r12G5E8G1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r12G5E8G1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r12G5E8G1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r12G5E8G1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r12G5E8G1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r12G5E8G1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r12G5E8G1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r12G5E8G1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r12G5E8G1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r12G5E8G1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Vmn1r12G5E8G1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r12G5E8G1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r12G5E8G1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r12G5E8G1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r12G5E8G1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r12G5E8G1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r12G5E8G1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r12G5E8G1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r12G5E8G1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r12G5E8G1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r12G5E8G1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r12G5E8G1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r12G5E8G1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r12G5E8G1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r12G5E8G1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r12G5E8G1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms