Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zc3h12bG3X9I7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zc3h12bG3X9I7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zc3h12bG3X9I7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zc3h12bG3X9I7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zc3h12bG3X9I7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Zc3h12bG3X9I7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Zc3h12bG3X9I7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zc3h12bG3X9I7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zc3h12bG3X9I7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zc3h12bG3X9I7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zc3h12bG3X9I7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zc3h12bG3X9I7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zc3h12bG3X9I7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zc3h12bG3X9I7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zc3h12bG3X9I7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zc3h12bG3X9I7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zc3h12bG3X9I7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zc3h12bG3X9I7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Zc3h12bG3X9I7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zc3h12bG3X9I7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Zc3h12bG3X9I7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zc3h12bG3X9I7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zc3h12bG3X9I7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zc3h12bG3X9I7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zc3h12bG3X9I7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zc3h12bG3X9I7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zc3h12bG3X9I7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zc3h12bG3X9I7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zc3h12bG3X9I7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zc3h12bG3X9I7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Zc3h12bG3X9I7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zc3h12bG3X9I7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zc3h12bG3X9I7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zc3h12bG3X9I7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zc3h12bG3X9I7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zc3h12bG3X9I7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zc3h12bG3X9I7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zc3h12bG3X9I7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zc3h12bG3X9I7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zc3h12bG3X9I7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zc3h12bG3X9I7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zc3h12bG3X9I7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zc3h12bG3X9I7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zc3h12bG3X9I7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zc3h12bG3X9I7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zc3h12bG3X9I7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zc3h12bG3X9I7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zc3h12bG3X9I7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zc3h12bG3X9I7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zc3h12bG3X9I7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Zc3h12bG3X9I7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zc3h12bG3X9I7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zc3h12bG3X9I7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zc3h12bG3X9I7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zc3h12bG3X9I7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zc3h12bG3X9I7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zc3h12bG3X9I7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zc3h12bG3X9I7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zc3h12bG3X9I7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zc3h12bG3X9I7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zc3h12bG3X9I7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zc3h12bG3X9I7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zc3h12bG3X9I7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Zc3h12bG3X9I7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Zc3h12bG3X9I7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zc3h12bG3X9I7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zc3h12bG3X9I7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zc3h12bG3X9I7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zc3h12bG3X9I7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zc3h12bG3X9I7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zc3h12bG3X9I7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zc3h12bG3X9I7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Zc3h12bG3X9I7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zc3h12bG3X9I7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zc3h12bG3X9I7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zc3h12bG3X9I7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zc3h12bG3X9I7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zc3h12bG3X9I7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zc3h12bG3X9I7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zc3h12bG3X9I7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zc3h12bG3X9I7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zc3h12bG3X9I7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zc3h12bG3X9I7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zc3h12bG3X9I7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zc3h12bG3X9I7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zc3h12bG3X9I7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zc3h12bG3X9I7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zc3h12bG3X9I7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zc3h12bG3X9I7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zc3h12bG3X9I7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zc3h12bG3X9I7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zc3h12bG3X9I7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Zc3h12bG3X9I7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zc3h12bG3X9I7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zc3h12bG3X9I7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zc3h12bG3X9I7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zc3h12bG3X9I7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zc3h12bG3X9I7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zc3h12bG3X9I7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms