Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn34aG3UW52 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn34aG3UW52 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn34aG3UW52 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn34aG3UW52 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn34aG3UW52 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn34aG3UW52 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn34aG3UW52 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn34aG3UW52 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn34aG3UW52 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn34aG3UW52 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn34aG3UW52 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn34aG3UW52 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn34aG3UW52 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn34aG3UW52 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn34aG3UW52 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn34aG3UW52 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn34aG3UW52 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn34aG3UW52 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn34aG3UW52 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn34aG3UW52 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn34aG3UW52 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn34aG3UW52 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cldn34aG3UW52 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn34aG3UW52 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn34aG3UW52 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn34aG3UW52 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn34aG3UW52 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn34aG3UW52 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn34aG3UW52 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn34aG3UW52 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn34aG3UW52 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn34aG3UW52 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn34aG3UW52 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn34aG3UW52 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn34aG3UW52 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn34aG3UW52 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn34aG3UW52 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn34aG3UW52 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn34aG3UW52 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn34aG3UW52 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn34aG3UW52 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn34aG3UW52 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn34aG3UW52 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn34aG3UW52 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn34aG3UW52 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn34aG3UW52 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn34aG3UW52 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn34aG3UW52 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn34aG3UW52 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn34aG3UW52 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn34aG3UW52 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn34aG3UW52 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn34aG3UW52 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn34aG3UW52 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn34aG3UW52 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn34aG3UW52 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn34aG3UW52 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn34aG3UW52 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cldn34aG3UW52 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn34aG3UW52 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn34aG3UW52 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn34aG3UW52 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn34aG3UW52 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn34aG3UW52 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn34aG3UW52 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn34aG3UW52 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn34aG3UW52 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn34aG3UW52 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn34aG3UW52 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn34aG3UW52 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn34aG3UW52 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn34aG3UW52 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn34aG3UW52 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn34aG3UW52 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn34aG3UW52 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn34aG3UW52 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn34aG3UW52 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn34aG3UW52 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn34aG3UW52 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn34aG3UW52 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cldn34aG3UW52 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cldn34aG3UW52 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn34aG3UW52 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn34aG3UW52 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn34aG3UW52 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn34aG3UW52 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn34aG3UW52 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn34aG3UW52 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn34aG3UW52 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn34aG3UW52 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn34aG3UW52 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn34aG3UW52 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn34aG3UW52 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn34aG3UW52 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn34aG3UW52 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn34aG3UW52 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn34aG3UW52 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn34aG3UW52 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn34aG3UW52 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms