Protein–RNA interactions for Protein: F6VUT6

Gm8251, Predicted gene 8251, mousemouse

Predictions only

Length 1,994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8251F6VUT6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8251F6VUT6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8251F6VUT6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8251F6VUT6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8251F6VUT6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8251F6VUT6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8251F6VUT6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8251F6VUT6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8251F6VUT6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8251F6VUT6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8251F6VUT6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm8251F6VUT6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm8251F6VUT6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8251F6VUT6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8251F6VUT6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8251F6VUT6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8251F6VUT6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8251F6VUT6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8251F6VUT6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8251F6VUT6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8251F6VUT6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8251F6VUT6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8251F6VUT6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8251F6VUT6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8251F6VUT6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8251F6VUT6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8251F6VUT6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8251F6VUT6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8251F6VUT6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8251F6VUT6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8251F6VUT6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8251F6VUT6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8251F6VUT6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8251F6VUT6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8251F6VUT6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8251F6VUT6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8251F6VUT6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8251F6VUT6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8251F6VUT6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8251F6VUT6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8251F6VUT6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8251F6VUT6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8251F6VUT6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8251F6VUT6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8251F6VUT6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8251F6VUT6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8251F6VUT6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8251F6VUT6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8251F6VUT6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm8251F6VUT6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8251F6VUT6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8251F6VUT6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8251F6VUT6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8251F6VUT6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8251F6VUT6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8251F6VUT6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8251F6VUT6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8251F6VUT6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8251F6VUT6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8251F6VUT6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8251F6VUT6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8251F6VUT6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8251F6VUT6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8251F6VUT6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8251F6VUT6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8251F6VUT6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm8251F6VUT6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8251F6VUT6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8251F6VUT6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8251F6VUT6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8251F6VUT6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8251F6VUT6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8251F6VUT6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8251F6VUT6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8251F6VUT6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8251F6VUT6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8251F6VUT6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8251F6VUT6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8251F6VUT6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8251F6VUT6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8251F6VUT6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8251F6VUT6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8251F6VUT6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8251F6VUT6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8251F6VUT6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm8251F6VUT6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm8251F6VUT6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8251F6VUT6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8251F6VUT6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8251F6VUT6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8251F6VUT6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8251F6VUT6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8251F6VUT6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8251F6VUT6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8251F6VUT6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8251F6VUT6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8251F6VUT6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8251F6VUT6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8251F6VUT6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8251F6VUT6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms