Protein–RNA interactions for Protein: F6TNE3

Prr22, Proline-rich 22, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr22F6TNE3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prr22F6TNE3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Prr22F6TNE3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prr22F6TNE3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prr22F6TNE3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prr22F6TNE3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prr22F6TNE3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prr22F6TNE3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prr22F6TNE3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prr22F6TNE3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prr22F6TNE3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Prr22F6TNE3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Prr22F6TNE3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prr22F6TNE3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Prr22F6TNE3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prr22F6TNE3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prr22F6TNE3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prr22F6TNE3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prr22F6TNE3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prr22F6TNE3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prr22F6TNE3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prr22F6TNE3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Prr22F6TNE3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prr22F6TNE3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prr22F6TNE3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prr22F6TNE3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prr22F6TNE3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prr22F6TNE3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prr22F6TNE3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prr22F6TNE3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prr22F6TNE3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prr22F6TNE3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prr22F6TNE3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prr22F6TNE3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prr22F6TNE3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prr22F6TNE3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prr22F6TNE3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prr22F6TNE3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prr22F6TNE3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prr22F6TNE3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prr22F6TNE3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prr22F6TNE3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prr22F6TNE3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prr22F6TNE3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prr22F6TNE3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr22F6TNE3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr22F6TNE3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr22F6TNE3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr22F6TNE3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr22F6TNE3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr22F6TNE3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr22F6TNE3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prr22F6TNE3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prr22F6TNE3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Prr22F6TNE3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prr22F6TNE3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Prr22F6TNE3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prr22F6TNE3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prr22F6TNE3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prr22F6TNE3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prr22F6TNE3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prr22F6TNE3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prr22F6TNE3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prr22F6TNE3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prr22F6TNE3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr22F6TNE3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr22F6TNE3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr22F6TNE3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Prr22F6TNE3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Prr22F6TNE3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prr22F6TNE3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prr22F6TNE3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prr22F6TNE3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prr22F6TNE3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prr22F6TNE3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prr22F6TNE3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prr22F6TNE3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prr22F6TNE3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prr22F6TNE3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prr22F6TNE3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prr22F6TNE3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prr22F6TNE3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prr22F6TNE3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Prr22F6TNE3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prr22F6TNE3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prr22F6TNE3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prr22F6TNE3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prr22F6TNE3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Prr22F6TNE3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prr22F6TNE3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prr22F6TNE3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prr22F6TNE3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prr22F6TNE3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prr22F6TNE3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prr22F6TNE3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prr22F6TNE3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Prr22F6TNE3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prr22F6TNE3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prr22F6TNE3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prr22F6TNE3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms