Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm20518E9Q548 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm20518E9Q548 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm20518E9Q548 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm20518E9Q548 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm20518E9Q548 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm20518E9Q548 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm20518E9Q548 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm20518E9Q548 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm20518E9Q548 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm20518E9Q548 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm20518E9Q548 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm20518E9Q548 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm20518E9Q548 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm20518E9Q548 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm20518E9Q548 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm20518E9Q548 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20518E9Q548 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20518E9Q548 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20518E9Q548 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20518E9Q548 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20518E9Q548 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20518E9Q548 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20518E9Q548 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20518E9Q548 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20518E9Q548 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20518E9Q548 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20518E9Q548 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20518E9Q548 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20518E9Q548 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20518E9Q548 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20518E9Q548 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20518E9Q548 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20518E9Q548 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20518E9Q548 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20518E9Q548 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20518E9Q548 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20518E9Q548 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20518E9Q548 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20518E9Q548 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20518E9Q548 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20518E9Q548 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20518E9Q548 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20518E9Q548 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20518E9Q548 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20518E9Q548 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20518E9Q548 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20518E9Q548 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20518E9Q548 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20518E9Q548 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20518E9Q548 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20518E9Q548 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20518E9Q548 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20518E9Q548 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20518E9Q548 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20518E9Q548 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20518E9Q548 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20518E9Q548 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20518E9Q548 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20518E9Q548 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20518E9Q548 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20518E9Q548 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20518E9Q548 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20518E9Q548 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20518E9Q548 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20518E9Q548 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20518E9Q548 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20518E9Q548 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20518E9Q548 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20518E9Q548 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20518E9Q548 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20518E9Q548 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20518E9Q548 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20518E9Q548 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm20518E9Q548 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm20518E9Q548 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm20518E9Q548 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm20518E9Q548 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm20518E9Q548 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm20518E9Q548 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm20518E9Q548 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20518E9Q548 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20518E9Q548 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20518E9Q548 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20518E9Q548 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm20518E9Q548 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20518E9Q548 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20518E9Q548 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20518E9Q548 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm20518E9Q548 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm20518E9Q548 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20518E9Q548 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20518E9Q548 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20518E9Q548 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20518E9Q548 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20518E9Q548 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20518E9Q548 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20518E9Q548 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20518E9Q548 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20518E9Q548 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms