Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r238E9Q373 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r238E9Q373 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r238E9Q373 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r238E9Q373 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r238E9Q373 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r238E9Q373 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r238E9Q373 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r238E9Q373 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r238E9Q373 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r238E9Q373 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r238E9Q373 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r238E9Q373 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r238E9Q373 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r238E9Q373 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r238E9Q373 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r238E9Q373 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r238E9Q373 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r238E9Q373 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r238E9Q373 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r238E9Q373 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r238E9Q373 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r238E9Q373 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r238E9Q373 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r238E9Q373 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r238E9Q373 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r238E9Q373 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r238E9Q373 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r238E9Q373 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r238E9Q373 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r238E9Q373 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r238E9Q373 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r238E9Q373 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r238E9Q373 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r238E9Q373 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r238E9Q373 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r238E9Q373 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r238E9Q373 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r238E9Q373 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r238E9Q373 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r238E9Q373 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r238E9Q373 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r238E9Q373 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r238E9Q373 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r238E9Q373 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r238E9Q373 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r238E9Q373 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r238E9Q373 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r238E9Q373 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r238E9Q373 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r238E9Q373 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r238E9Q373 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r238E9Q373 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r238E9Q373 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r238E9Q373 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r238E9Q373 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r238E9Q373 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r238E9Q373 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r238E9Q373 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r238E9Q373 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r238E9Q373 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r238E9Q373 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r238E9Q373 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r238E9Q373 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r238E9Q373 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r238E9Q373 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms