Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
5430401F13RikE9Q328 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
5430401F13RikE9Q328 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
5430401F13RikE9Q328 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
5430401F13RikE9Q328 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
5430401F13RikE9Q328 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
5430401F13RikE9Q328 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
5430401F13RikE9Q328 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
5430401F13RikE9Q328 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
5430401F13RikE9Q328 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
5430401F13RikE9Q328 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
5430401F13RikE9Q328 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
5430401F13RikE9Q328 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
5430401F13RikE9Q328 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
5430401F13RikE9Q328 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
5430401F13RikE9Q328 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
5430401F13RikE9Q328 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
5430401F13RikE9Q328 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
5430401F13RikE9Q328 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
5430401F13RikE9Q328 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
5430401F13RikE9Q328 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
5430401F13RikE9Q328 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
5430401F13RikE9Q328 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
5430401F13RikE9Q328 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
5430401F13RikE9Q328 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
5430401F13RikE9Q328 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
5430401F13RikE9Q328 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
5430401F13RikE9Q328 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
5430401F13RikE9Q328 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
5430401F13RikE9Q328 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
5430401F13RikE9Q328 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
5430401F13RikE9Q328 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
5430401F13RikE9Q328 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
5430401F13RikE9Q328 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
5430401F13RikE9Q328 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
5430401F13RikE9Q328 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
5430401F13RikE9Q328 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
5430401F13RikE9Q328 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
5430401F13RikE9Q328 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
5430401F13RikE9Q328 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
5430401F13RikE9Q328 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
5430401F13RikE9Q328 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
5430401F13RikE9Q328 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
5430401F13RikE9Q328 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
5430401F13RikE9Q328 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
5430401F13RikE9Q328 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
5430401F13RikE9Q328 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
5430401F13RikE9Q328 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
5430401F13RikE9Q328 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
5430401F13RikE9Q328 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
5430401F13RikE9Q328 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
5430401F13RikE9Q328 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
5430401F13RikE9Q328 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
5430401F13RikE9Q328 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
5430401F13RikE9Q328 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
5430401F13RikE9Q328 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
5430401F13RikE9Q328 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
5430401F13RikE9Q328 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
5430401F13RikE9Q328 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
5430401F13RikE9Q328 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
5430401F13RikE9Q328 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
5430401F13RikE9Q328 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
5430401F13RikE9Q328 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
5430401F13RikE9Q328 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
5430401F13RikE9Q328 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
5430401F13RikE9Q328 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
5430401F13RikE9Q328 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
5430401F13RikE9Q328 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
5430401F13RikE9Q328 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
5430401F13RikE9Q328 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
5430401F13RikE9Q328 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
5430401F13RikE9Q328 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
5430401F13RikE9Q328 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
5430401F13RikE9Q328 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
5430401F13RikE9Q328 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
5430401F13RikE9Q328 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
5430401F13RikE9Q328 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
5430401F13RikE9Q328 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
5430401F13RikE9Q328 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
5430401F13RikE9Q328 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
5430401F13RikE9Q328 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
5430401F13RikE9Q328 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
5430401F13RikE9Q328 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
5430401F13RikE9Q328 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
5430401F13RikE9Q328 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
5430401F13RikE9Q328 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
5430401F13RikE9Q328 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
5430401F13RikE9Q328 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
5430401F13RikE9Q328 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
5430401F13RikE9Q328 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
5430401F13RikE9Q328 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
5430401F13RikE9Q328 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
5430401F13RikE9Q328 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
5430401F13RikE9Q328 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
5430401F13RikE9Q328 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
5430401F13RikE9Q328 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
5430401F13RikE9Q328 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
5430401F13RikE9Q328 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
5430401F13RikE9Q328 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
5430401F13RikE9Q328 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms