Protein–RNA interactions for Protein: E9Q309

Cep350, Centrosome-associated protein 350, mousemouse

Predictions only

Length 3,095 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep350E9Q309 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cep350E9Q309 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cep350E9Q309 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cep350E9Q309 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cep350E9Q309 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cep350E9Q309 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cep350E9Q309 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cep350E9Q309 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cep350E9Q309 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cep350E9Q309 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cep350E9Q309 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cep350E9Q309 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cep350E9Q309 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cep350E9Q309 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cep350E9Q309 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cep350E9Q309 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cep350E9Q309 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cep350E9Q309 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cep350E9Q309 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cep350E9Q309 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cep350E9Q309 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cep350E9Q309 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cep350E9Q309 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cep350E9Q309 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep350E9Q309 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep350E9Q309 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep350E9Q309 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep350E9Q309 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep350E9Q309 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep350E9Q309 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep350E9Q309 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep350E9Q309 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep350E9Q309 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep350E9Q309 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cep350E9Q309 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cep350E9Q309 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep350E9Q309 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cep350E9Q309 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cep350E9Q309 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cep350E9Q309 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cep350E9Q309 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cep350E9Q309 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cep350E9Q309 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cep350E9Q309 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cep350E9Q309 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cep350E9Q309 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cep350E9Q309 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cep350E9Q309 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cep350E9Q309 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cep350E9Q309 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cep350E9Q309 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep350E9Q309 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep350E9Q309 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep350E9Q309 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep350E9Q309 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep350E9Q309 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cep350E9Q309 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep350E9Q309 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep350E9Q309 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep350E9Q309 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep350E9Q309 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep350E9Q309 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep350E9Q309 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep350E9Q309 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep350E9Q309 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep350E9Q309 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep350E9Q309 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep350E9Q309 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep350E9Q309 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep350E9Q309 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep350E9Q309 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep350E9Q309 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep350E9Q309 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep350E9Q309 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep350E9Q309 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep350E9Q309 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep350E9Q309 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep350E9Q309 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep350E9Q309 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep350E9Q309 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cep350E9Q309 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cep350E9Q309 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cep350E9Q309 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cep350E9Q309 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cep350E9Q309 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep350E9Q309 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep350E9Q309 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep350E9Q309 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep350E9Q309 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cep350E9Q309 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cep350E9Q309 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cep350E9Q309 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cep350E9Q309 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cep350E9Q309 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cep350E9Q309 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cep350E9Q309 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cep350E9Q309 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cep350E9Q309 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cep350E9Q309 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cep350E9Q309 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms